Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP3

Mical1, [F-actin]-monooxygenase MICAL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mical1Q8VDP3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mical1Q8VDP3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mical1Q8VDP3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mical1Q8VDP3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mical1Q8VDP3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mical1Q8VDP3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mical1Q8VDP3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mical1Q8VDP3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Mical1Q8VDP3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mical1Q8VDP3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mical1Q8VDP3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Mical1Q8VDP3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mical1Q8VDP3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mical1Q8VDP3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Mical1Q8VDP3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mical1Q8VDP3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Mical1Q8VDP3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mical1Q8VDP3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mical1Q8VDP3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mical1Q8VDP3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Mical1Q8VDP3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mical1Q8VDP3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mical1Q8VDP3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mical1Q8VDP3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mical1Q8VDP3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Mical1Q8VDP3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Mical1Q8VDP3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mical1Q8VDP3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mical1Q8VDP3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mical1Q8VDP3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mical1Q8VDP3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mical1Q8VDP3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mical1Q8VDP3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mical1Q8VDP3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mical1Q8VDP3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mical1Q8VDP3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mical1Q8VDP3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mical1Q8VDP3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mical1Q8VDP3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mical1Q8VDP3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mical1Q8VDP3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mical1Q8VDP3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mical1Q8VDP3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Mical1Q8VDP3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mical1Q8VDP3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mical1Q8VDP3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mical1Q8VDP3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mical1Q8VDP3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mical1Q8VDP3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mical1Q8VDP3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mical1Q8VDP3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mical1Q8VDP3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mical1Q8VDP3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mical1Q8VDP3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mical1Q8VDP3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mical1Q8VDP3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mical1Q8VDP3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mical1Q8VDP3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mical1Q8VDP3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mical1Q8VDP3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mical1Q8VDP3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mical1Q8VDP3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mical1Q8VDP3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mical1Q8VDP3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mical1Q8VDP3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mical1Q8VDP3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mical1Q8VDP3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mical1Q8VDP3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Mical1Q8VDP3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mical1Q8VDP3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mical1Q8VDP3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mical1Q8VDP3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mical1Q8VDP3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mical1Q8VDP3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mical1Q8VDP3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mical1Q8VDP3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mical1Q8VDP3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mical1Q8VDP3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Mical1Q8VDP3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mical1Q8VDP3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mical1Q8VDP3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mical1Q8VDP3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mical1Q8VDP3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mical1Q8VDP3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mical1Q8VDP3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mical1Q8VDP3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mical1Q8VDP3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mical1Q8VDP3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mical1Q8VDP3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mical1Q8VDP3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mical1Q8VDP3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mical1Q8VDP3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mical1Q8VDP3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mical1Q8VDP3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Mical1Q8VDP3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mical1Q8VDP3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mical1Q8VDP3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Mical1Q8VDP3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Mical1Q8VDP3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Mical1Q8VDP3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms