Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB2

Alg12, Dol-P-Man:Man(7)GlcNAc(2)-PP-Dol alpha-1,6-mannosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg12Q8VDB2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Alg12Q8VDB2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Alg12Q8VDB2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Alg12Q8VDB2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Alg12Q8VDB2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Alg12Q8VDB2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Alg12Q8VDB2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Alg12Q8VDB2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Alg12Q8VDB2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Alg12Q8VDB2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Alg12Q8VDB2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Alg12Q8VDB2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Alg12Q8VDB2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Alg12Q8VDB2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Alg12Q8VDB2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Alg12Q8VDB2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Alg12Q8VDB2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Alg12Q8VDB2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Alg12Q8VDB2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Alg12Q8VDB2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Alg12Q8VDB2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Alg12Q8VDB2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Alg12Q8VDB2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Alg12Q8VDB2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Alg12Q8VDB2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Alg12Q8VDB2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Alg12Q8VDB2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Alg12Q8VDB2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Alg12Q8VDB2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Alg12Q8VDB2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Alg12Q8VDB2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Alg12Q8VDB2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Alg12Q8VDB2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Alg12Q8VDB2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Alg12Q8VDB2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Alg12Q8VDB2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Alg12Q8VDB2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Alg12Q8VDB2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Alg12Q8VDB2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Alg12Q8VDB2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Alg12Q8VDB2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Alg12Q8VDB2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Alg12Q8VDB2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Alg12Q8VDB2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Alg12Q8VDB2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Alg12Q8VDB2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Alg12Q8VDB2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Alg12Q8VDB2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Alg12Q8VDB2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Alg12Q8VDB2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Alg12Q8VDB2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Alg12Q8VDB2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Alg12Q8VDB2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Alg12Q8VDB2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Alg12Q8VDB2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Alg12Q8VDB2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Alg12Q8VDB2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Alg12Q8VDB2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Alg12Q8VDB2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Alg12Q8VDB2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Alg12Q8VDB2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Alg12Q8VDB2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Alg12Q8VDB2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Alg12Q8VDB2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Alg12Q8VDB2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Alg12Q8VDB2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Alg12Q8VDB2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Alg12Q8VDB2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Alg12Q8VDB2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Alg12Q8VDB2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Alg12Q8VDB2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Alg12Q8VDB2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Alg12Q8VDB2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Alg12Q8VDB2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Alg12Q8VDB2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Alg12Q8VDB2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Alg12Q8VDB2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Alg12Q8VDB2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Alg12Q8VDB2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alg12Q8VDB2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alg12Q8VDB2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alg12Q8VDB2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alg12Q8VDB2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Alg12Q8VDB2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Alg12Q8VDB2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Alg12Q8VDB2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Alg12Q8VDB2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alg12Q8VDB2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Alg12Q8VDB2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Alg12Q8VDB2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Alg12Q8VDB2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alg12Q8VDB2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alg12Q8VDB2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alg12Q8VDB2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alg12Q8VDB2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alg12Q8VDB2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Alg12Q8VDB2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Alg12Q8VDB2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Alg12Q8VDB2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Alg12Q8VDB2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms