Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ubxn4Q8VCH8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ubxn4Q8VCH8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Ubxn4Q8VCH8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ubxn4Q8VCH8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ubxn4Q8VCH8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Ubxn4Q8VCH8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ubxn4Q8VCH8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ubxn4Q8VCH8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ubxn4Q8VCH8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ubxn4Q8VCH8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ubxn4Q8VCH8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ubxn4Q8VCH8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ubxn4Q8VCH8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ubxn4Q8VCH8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ubxn4Q8VCH8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ubxn4Q8VCH8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ubxn4Q8VCH8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ubxn4Q8VCH8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ubxn4Q8VCH8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ubxn4Q8VCH8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ubxn4Q8VCH8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ubxn4Q8VCH8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ubxn4Q8VCH8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ubxn4Q8VCH8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ubxn4Q8VCH8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ubxn4Q8VCH8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ubxn4Q8VCH8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ubxn4Q8VCH8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ubxn4Q8VCH8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ubxn4Q8VCH8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ubxn4Q8VCH8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ubxn4Q8VCH8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ubxn4Q8VCH8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ubxn4Q8VCH8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ubxn4Q8VCH8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ubxn4Q8VCH8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ubxn4Q8VCH8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ubxn4Q8VCH8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ubxn4Q8VCH8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ubxn4Q8VCH8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ubxn4Q8VCH8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ubxn4Q8VCH8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ubxn4Q8VCH8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ubxn4Q8VCH8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Ubxn4Q8VCH8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ubxn4Q8VCH8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ubxn4Q8VCH8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ubxn4Q8VCH8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ubxn4Q8VCH8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ubxn4Q8VCH8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ubxn4Q8VCH8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ubxn4Q8VCH8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ubxn4Q8VCH8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ubxn4Q8VCH8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ubxn4Q8VCH8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ubxn4Q8VCH8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ubxn4Q8VCH8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ubxn4Q8VCH8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ubxn4Q8VCH8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ubxn4Q8VCH8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ubxn4Q8VCH8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ubxn4Q8VCH8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ubxn4Q8VCH8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ubxn4Q8VCH8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ubxn4Q8VCH8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ubxn4Q8VCH8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ubxn4Q8VCH8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ubxn4Q8VCH8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ubxn4Q8VCH8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ubxn4Q8VCH8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ubxn4Q8VCH8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ubxn4Q8VCH8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ubxn4Q8VCH8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ubxn4Q8VCH8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ubxn4Q8VCH8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ubxn4Q8VCH8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ubxn4Q8VCH8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ubxn4Q8VCH8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ubxn4Q8VCH8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ubxn4Q8VCH8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ubxn4Q8VCH8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ubxn4Q8VCH8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ubxn4Q8VCH8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ubxn4Q8VCH8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ubxn4Q8VCH8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ubxn4Q8VCH8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ubxn4Q8VCH8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ubxn4Q8VCH8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ubxn4Q8VCH8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ubxn4Q8VCH8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms