Protein–RNA interactions for Protein: Q8R574

Prpsap2, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap2Q8R574 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prpsap2Q8R574 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prpsap2Q8R574 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prpsap2Q8R574 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prpsap2Q8R574 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prpsap2Q8R574 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prpsap2Q8R574 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prpsap2Q8R574 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prpsap2Q8R574 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Prpsap2Q8R574 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prpsap2Q8R574 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prpsap2Q8R574 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prpsap2Q8R574 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prpsap2Q8R574 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prpsap2Q8R574 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Prpsap2Q8R574 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prpsap2Q8R574 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prpsap2Q8R574 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prpsap2Q8R574 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prpsap2Q8R574 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prpsap2Q8R574 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prpsap2Q8R574 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prpsap2Q8R574 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prpsap2Q8R574 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prpsap2Q8R574 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prpsap2Q8R574 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prpsap2Q8R574 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prpsap2Q8R574 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prpsap2Q8R574 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Prpsap2Q8R574 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Prpsap2Q8R574 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prpsap2Q8R574 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prpsap2Q8R574 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prpsap2Q8R574 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Prpsap2Q8R574 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prpsap2Q8R574 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prpsap2Q8R574 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prpsap2Q8R574 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prpsap2Q8R574 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prpsap2Q8R574 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prpsap2Q8R574 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prpsap2Q8R574 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Prpsap2Q8R574 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prpsap2Q8R574 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prpsap2Q8R574 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prpsap2Q8R574 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prpsap2Q8R574 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prpsap2Q8R574 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prpsap2Q8R574 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prpsap2Q8R574 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prpsap2Q8R574 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prpsap2Q8R574 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Prpsap2Q8R574 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prpsap2Q8R574 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prpsap2Q8R574 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prpsap2Q8R574 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prpsap2Q8R574 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prpsap2Q8R574 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prpsap2Q8R574 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prpsap2Q8R574 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prpsap2Q8R574 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prpsap2Q8R574 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Prpsap2Q8R574 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prpsap2Q8R574 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Prpsap2Q8R574 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prpsap2Q8R574 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prpsap2Q8R574 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prpsap2Q8R574 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prpsap2Q8R574 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prpsap2Q8R574 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prpsap2Q8R574 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prpsap2Q8R574 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prpsap2Q8R574 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prpsap2Q8R574 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prpsap2Q8R574 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prpsap2Q8R574 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prpsap2Q8R574 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prpsap2Q8R574 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prpsap2Q8R574 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prpsap2Q8R574 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prpsap2Q8R574 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prpsap2Q8R574 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prpsap2Q8R574 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prpsap2Q8R574 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prpsap2Q8R574 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prpsap2Q8R574 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prpsap2Q8R574 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prpsap2Q8R574 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prpsap2Q8R574 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prpsap2Q8R574 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prpsap2Q8R574 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prpsap2Q8R574 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prpsap2Q8R574 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prpsap2Q8R574 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prpsap2Q8R574 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prpsap2Q8R574 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prpsap2Q8R574 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prpsap2Q8R574 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prpsap2Q8R574 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prpsap2Q8R574 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms