Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W2

0610009B22Rik, MCG6979, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610009B22RikQ8R3W2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
0610009B22RikQ8R3W2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
0610009B22RikQ8R3W2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
0610009B22RikQ8R3W2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
0610009B22RikQ8R3W2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
0610009B22RikQ8R3W2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
0610009B22RikQ8R3W2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
0610009B22RikQ8R3W2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
0610009B22RikQ8R3W2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
0610009B22RikQ8R3W2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
0610009B22RikQ8R3W2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
0610009B22RikQ8R3W2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
0610009B22RikQ8R3W2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
0610009B22RikQ8R3W2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
0610009B22RikQ8R3W2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
0610009B22RikQ8R3W2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
0610009B22RikQ8R3W2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
0610009B22RikQ8R3W2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
0610009B22RikQ8R3W2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
0610009B22RikQ8R3W2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
0610009B22RikQ8R3W2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
0610009B22RikQ8R3W2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
0610009B22RikQ8R3W2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
0610009B22RikQ8R3W2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
0610009B22RikQ8R3W2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
0610009B22RikQ8R3W2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
0610009B22RikQ8R3W2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
0610009B22RikQ8R3W2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
0610009B22RikQ8R3W2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
0610009B22RikQ8R3W2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
0610009B22RikQ8R3W2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
0610009B22RikQ8R3W2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
0610009B22RikQ8R3W2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
0610009B22RikQ8R3W2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
0610009B22RikQ8R3W2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
0610009B22RikQ8R3W2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
0610009B22RikQ8R3W2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
0610009B22RikQ8R3W2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
0610009B22RikQ8R3W2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
0610009B22RikQ8R3W2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
0610009B22RikQ8R3W2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
0610009B22RikQ8R3W2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
0610009B22RikQ8R3W2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
0610009B22RikQ8R3W2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
0610009B22RikQ8R3W2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
0610009B22RikQ8R3W2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
0610009B22RikQ8R3W2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
0610009B22RikQ8R3W2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
0610009B22RikQ8R3W2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
0610009B22RikQ8R3W2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
0610009B22RikQ8R3W2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
0610009B22RikQ8R3W2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
0610009B22RikQ8R3W2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
0610009B22RikQ8R3W2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
0610009B22RikQ8R3W2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
0610009B22RikQ8R3W2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
0610009B22RikQ8R3W2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
0610009B22RikQ8R3W2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
0610009B22RikQ8R3W2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
0610009B22RikQ8R3W2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
0610009B22RikQ8R3W2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
0610009B22RikQ8R3W2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
0610009B22RikQ8R3W2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
0610009B22RikQ8R3W2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
0610009B22RikQ8R3W2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
0610009B22RikQ8R3W2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
0610009B22RikQ8R3W2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
0610009B22RikQ8R3W2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
0610009B22RikQ8R3W2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
0610009B22RikQ8R3W2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
0610009B22RikQ8R3W2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
0610009B22RikQ8R3W2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
0610009B22RikQ8R3W2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
0610009B22RikQ8R3W2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
0610009B22RikQ8R3W2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
0610009B22RikQ8R3W2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
0610009B22RikQ8R3W2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
0610009B22RikQ8R3W2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
0610009B22RikQ8R3W2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
0610009B22RikQ8R3W2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
0610009B22RikQ8R3W2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
0610009B22RikQ8R3W2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
0610009B22RikQ8R3W2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
0610009B22RikQ8R3W2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
0610009B22RikQ8R3W2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
0610009B22RikQ8R3W2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
0610009B22RikQ8R3W2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
0610009B22RikQ8R3W2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
0610009B22RikQ8R3W2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
0610009B22RikQ8R3W2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
0610009B22RikQ8R3W2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
0610009B22RikQ8R3W2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
0610009B22RikQ8R3W2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
0610009B22RikQ8R3W2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
0610009B22RikQ8R3W2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
0610009B22RikQ8R3W2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
0610009B22RikQ8R3W2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
0610009B22RikQ8R3W2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
0610009B22RikQ8R3W2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
0610009B22RikQ8R3W2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms