Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1B5

Cplx3, Complexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cplx3Q8R1B5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cplx3Q8R1B5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cplx3Q8R1B5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cplx3Q8R1B5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cplx3Q8R1B5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cplx3Q8R1B5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cplx3Q8R1B5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cplx3Q8R1B5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cplx3Q8R1B5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cplx3Q8R1B5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cplx3Q8R1B5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cplx3Q8R1B5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cplx3Q8R1B5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cplx3Q8R1B5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cplx3Q8R1B5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cplx3Q8R1B5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cplx3Q8R1B5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cplx3Q8R1B5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cplx3Q8R1B5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cplx3Q8R1B5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cplx3Q8R1B5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cplx3Q8R1B5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cplx3Q8R1B5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cplx3Q8R1B5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cplx3Q8R1B5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cplx3Q8R1B5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cplx3Q8R1B5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cplx3Q8R1B5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cplx3Q8R1B5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cplx3Q8R1B5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cplx3Q8R1B5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cplx3Q8R1B5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cplx3Q8R1B5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cplx3Q8R1B5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cplx3Q8R1B5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cplx3Q8R1B5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cplx3Q8R1B5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cplx3Q8R1B5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cplx3Q8R1B5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cplx3Q8R1B5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cplx3Q8R1B5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cplx3Q8R1B5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cplx3Q8R1B5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cplx3Q8R1B5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cplx3Q8R1B5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cplx3Q8R1B5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cplx3Q8R1B5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cplx3Q8R1B5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cplx3Q8R1B5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cplx3Q8R1B5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cplx3Q8R1B5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cplx3Q8R1B5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cplx3Q8R1B5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cplx3Q8R1B5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cplx3Q8R1B5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cplx3Q8R1B5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cplx3Q8R1B5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cplx3Q8R1B5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cplx3Q8R1B5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cplx3Q8R1B5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cplx3Q8R1B5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cplx3Q8R1B5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cplx3Q8R1B5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cplx3Q8R1B5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cplx3Q8R1B5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cplx3Q8R1B5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cplx3Q8R1B5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cplx3Q8R1B5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cplx3Q8R1B5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cplx3Q8R1B5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cplx3Q8R1B5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cplx3Q8R1B5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cplx3Q8R1B5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cplx3Q8R1B5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cplx3Q8R1B5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cplx3Q8R1B5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cplx3Q8R1B5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cplx3Q8R1B5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cplx3Q8R1B5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cplx3Q8R1B5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cplx3Q8R1B5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cplx3Q8R1B5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cplx3Q8R1B5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cplx3Q8R1B5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cplx3Q8R1B5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cplx3Q8R1B5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cplx3Q8R1B5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cplx3Q8R1B5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cplx3Q8R1B5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cplx3Q8R1B5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cplx3Q8R1B5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cplx3Q8R1B5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cplx3Q8R1B5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cplx3Q8R1B5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cplx3Q8R1B5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cplx3Q8R1B5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cplx3Q8R1B5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cplx3Q8R1B5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cplx3Q8R1B5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cplx3Q8R1B5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms