Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Colec12Q8K4Q8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Colec12Q8K4Q8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Colec12Q8K4Q8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Colec12Q8K4Q8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Colec12Q8K4Q8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Colec12Q8K4Q8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Colec12Q8K4Q8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Colec12Q8K4Q8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Colec12Q8K4Q8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Colec12Q8K4Q8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Colec12Q8K4Q8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Colec12Q8K4Q8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Colec12Q8K4Q8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Colec12Q8K4Q8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Colec12Q8K4Q8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Colec12Q8K4Q8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Colec12Q8K4Q8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Colec12Q8K4Q8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Colec12Q8K4Q8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Colec12Q8K4Q8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Colec12Q8K4Q8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Colec12Q8K4Q8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Colec12Q8K4Q8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Colec12Q8K4Q8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Colec12Q8K4Q8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Colec12Q8K4Q8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Colec12Q8K4Q8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Colec12Q8K4Q8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Colec12Q8K4Q8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Colec12Q8K4Q8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Colec12Q8K4Q8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Colec12Q8K4Q8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Colec12Q8K4Q8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Colec12Q8K4Q8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Colec12Q8K4Q8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Colec12Q8K4Q8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Colec12Q8K4Q8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Colec12Q8K4Q8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Colec12Q8K4Q8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Colec12Q8K4Q8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Colec12Q8K4Q8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Colec12Q8K4Q8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Colec12Q8K4Q8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Colec12Q8K4Q8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Colec12Q8K4Q8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Colec12Q8K4Q8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Colec12Q8K4Q8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Colec12Q8K4Q8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Colec12Q8K4Q8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Colec12Q8K4Q8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Colec12Q8K4Q8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Colec12Q8K4Q8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Colec12Q8K4Q8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Colec12Q8K4Q8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Colec12Q8K4Q8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Colec12Q8K4Q8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Colec12Q8K4Q8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Colec12Q8K4Q8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Colec12Q8K4Q8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Colec12Q8K4Q8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Colec12Q8K4Q8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Colec12Q8K4Q8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Colec12Q8K4Q8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Colec12Q8K4Q8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Colec12Q8K4Q8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Colec12Q8K4Q8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Colec12Q8K4Q8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Colec12Q8K4Q8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Colec12Q8K4Q8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Colec12Q8K4Q8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Colec12Q8K4Q8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Colec12Q8K4Q8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Colec12Q8K4Q8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Colec12Q8K4Q8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Colec12Q8K4Q8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Colec12Q8K4Q8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Colec12Q8K4Q8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Colec12Q8K4Q8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Colec12Q8K4Q8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Colec12Q8K4Q8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Colec12Q8K4Q8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Colec12Q8K4Q8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Colec12Q8K4Q8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Colec12Q8K4Q8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Colec12Q8K4Q8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Colec12Q8K4Q8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Colec12Q8K4Q8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Colec12Q8K4Q8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Colec12Q8K4Q8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Colec12Q8K4Q8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Colec12Q8K4Q8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Colec12Q8K4Q8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Colec12Q8K4Q8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Colec12Q8K4Q8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Colec12Q8K4Q8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Colec12Q8K4Q8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Colec12Q8K4Q8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Colec12Q8K4Q8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Colec12Q8K4Q8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms