Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nsl1Q8K305 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nsl1Q8K305 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nsl1Q8K305 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nsl1Q8K305 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nsl1Q8K305 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nsl1Q8K305 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nsl1Q8K305 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nsl1Q8K305 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nsl1Q8K305 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nsl1Q8K305 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nsl1Q8K305 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nsl1Q8K305 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nsl1Q8K305 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nsl1Q8K305 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nsl1Q8K305 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nsl1Q8K305 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nsl1Q8K305 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nsl1Q8K305 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nsl1Q8K305 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nsl1Q8K305 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nsl1Q8K305 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nsl1Q8K305 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nsl1Q8K305 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nsl1Q8K305 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nsl1Q8K305 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nsl1Q8K305 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nsl1Q8K305 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Nsl1Q8K305 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nsl1Q8K305 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nsl1Q8K305 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nsl1Q8K305 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nsl1Q8K305 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nsl1Q8K305 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nsl1Q8K305 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nsl1Q8K305 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nsl1Q8K305 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nsl1Q8K305 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nsl1Q8K305 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nsl1Q8K305 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nsl1Q8K305 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nsl1Q8K305 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nsl1Q8K305 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nsl1Q8K305 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nsl1Q8K305 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nsl1Q8K305 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nsl1Q8K305 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nsl1Q8K305 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nsl1Q8K305 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nsl1Q8K305 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nsl1Q8K305 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nsl1Q8K305 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nsl1Q8K305 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nsl1Q8K305 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nsl1Q8K305 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nsl1Q8K305 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nsl1Q8K305 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nsl1Q8K305 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nsl1Q8K305 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nsl1Q8K305 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nsl1Q8K305 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nsl1Q8K305 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nsl1Q8K305 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nsl1Q8K305 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nsl1Q8K305 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nsl1Q8K305 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nsl1Q8K305 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nsl1Q8K305 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nsl1Q8K305 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nsl1Q8K305 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nsl1Q8K305 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nsl1Q8K305 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nsl1Q8K305 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nsl1Q8K305 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nsl1Q8K305 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nsl1Q8K305 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nsl1Q8K305 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nsl1Q8K305 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nsl1Q8K305 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nsl1Q8K305 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nsl1Q8K305 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nsl1Q8K305 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nsl1Q8K305 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Nsl1Q8K305 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nsl1Q8K305 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nsl1Q8K305 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nsl1Q8K305 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nsl1Q8K305 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nsl1Q8K305 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nsl1Q8K305 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nsl1Q8K305 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nsl1Q8K305 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nsl1Q8K305 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nsl1Q8K305 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nsl1Q8K305 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nsl1Q8K305 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nsl1Q8K305 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nsl1Q8K305 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nsl1Q8K305 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nsl1Q8K305 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms