Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stx5Q8K1E0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx5Q8K1E0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx5Q8K1E0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx5Q8K1E0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx5Q8K1E0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx5Q8K1E0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx5Q8K1E0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx5Q8K1E0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stx5Q8K1E0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stx5Q8K1E0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stx5Q8K1E0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx5Q8K1E0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx5Q8K1E0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stx5Q8K1E0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stx5Q8K1E0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Stx5Q8K1E0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx5Q8K1E0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx5Q8K1E0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stx5Q8K1E0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stx5Q8K1E0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stx5Q8K1E0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stx5Q8K1E0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stx5Q8K1E0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stx5Q8K1E0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stx5Q8K1E0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stx5Q8K1E0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx5Q8K1E0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx5Q8K1E0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx5Q8K1E0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx5Q8K1E0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stx5Q8K1E0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Stx5Q8K1E0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stx5Q8K1E0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stx5Q8K1E0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stx5Q8K1E0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stx5Q8K1E0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stx5Q8K1E0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stx5Q8K1E0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stx5Q8K1E0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stx5Q8K1E0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stx5Q8K1E0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stx5Q8K1E0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stx5Q8K1E0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stx5Q8K1E0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stx5Q8K1E0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stx5Q8K1E0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx5Q8K1E0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx5Q8K1E0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx5Q8K1E0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx5Q8K1E0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx5Q8K1E0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx5Q8K1E0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stx5Q8K1E0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stx5Q8K1E0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stx5Q8K1E0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx5Q8K1E0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx5Q8K1E0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stx5Q8K1E0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stx5Q8K1E0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stx5Q8K1E0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stx5Q8K1E0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx5Q8K1E0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx5Q8K1E0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx5Q8K1E0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx5Q8K1E0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx5Q8K1E0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx5Q8K1E0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx5Q8K1E0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx5Q8K1E0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx5Q8K1E0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx5Q8K1E0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stx5Q8K1E0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stx5Q8K1E0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Stx5Q8K1E0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stx5Q8K1E0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stx5Q8K1E0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stx5Q8K1E0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stx5Q8K1E0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx5Q8K1E0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx5Q8K1E0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx5Q8K1E0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stx5Q8K1E0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx5Q8K1E0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stx5Q8K1E0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stx5Q8K1E0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stx5Q8K1E0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stx5Q8K1E0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx5Q8K1E0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx5Q8K1E0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx5Q8K1E0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx5Q8K1E0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx5Q8K1E0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx5Q8K1E0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx5Q8K1E0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx5Q8K1E0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx5Q8K1E0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx5Q8K1E0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx5Q8K1E0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx5Q8K1E0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms