Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0Y2

Krt33a, Keratin, type I cuticular Ha3-I, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33aQ8K0Y2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt33aQ8K0Y2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt33aQ8K0Y2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt33aQ8K0Y2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt33aQ8K0Y2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt33aQ8K0Y2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt33aQ8K0Y2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt33aQ8K0Y2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt33aQ8K0Y2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt33aQ8K0Y2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt33aQ8K0Y2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt33aQ8K0Y2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt33aQ8K0Y2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt33aQ8K0Y2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt33aQ8K0Y2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt33aQ8K0Y2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt33aQ8K0Y2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt33aQ8K0Y2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt33aQ8K0Y2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt33aQ8K0Y2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt33aQ8K0Y2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt33aQ8K0Y2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt33aQ8K0Y2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt33aQ8K0Y2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt33aQ8K0Y2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt33aQ8K0Y2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt33aQ8K0Y2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt33aQ8K0Y2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt33aQ8K0Y2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt33aQ8K0Y2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt33aQ8K0Y2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt33aQ8K0Y2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt33aQ8K0Y2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt33aQ8K0Y2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt33aQ8K0Y2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt33aQ8K0Y2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt33aQ8K0Y2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt33aQ8K0Y2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt33aQ8K0Y2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt33aQ8K0Y2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt33aQ8K0Y2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt33aQ8K0Y2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt33aQ8K0Y2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt33aQ8K0Y2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt33aQ8K0Y2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt33aQ8K0Y2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt33aQ8K0Y2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt33aQ8K0Y2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt33aQ8K0Y2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt33aQ8K0Y2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt33aQ8K0Y2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt33aQ8K0Y2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt33aQ8K0Y2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt33aQ8K0Y2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt33aQ8K0Y2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt33aQ8K0Y2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt33aQ8K0Y2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt33aQ8K0Y2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt33aQ8K0Y2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt33aQ8K0Y2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt33aQ8K0Y2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt33aQ8K0Y2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt33aQ8K0Y2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt33aQ8K0Y2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt33aQ8K0Y2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt33aQ8K0Y2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt33aQ8K0Y2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Krt33aQ8K0Y2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt33aQ8K0Y2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt33aQ8K0Y2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt33aQ8K0Y2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt33aQ8K0Y2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt33aQ8K0Y2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt33aQ8K0Y2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt33aQ8K0Y2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt33aQ8K0Y2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt33aQ8K0Y2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt33aQ8K0Y2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt33aQ8K0Y2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krt33aQ8K0Y2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt33aQ8K0Y2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt33aQ8K0Y2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt33aQ8K0Y2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt33aQ8K0Y2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt33aQ8K0Y2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt33aQ8K0Y2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt33aQ8K0Y2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt33aQ8K0Y2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt33aQ8K0Y2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt33aQ8K0Y2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt33aQ8K0Y2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt33aQ8K0Y2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt33aQ8K0Y2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt33aQ8K0Y2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt33aQ8K0Y2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt33aQ8K0Y2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt33aQ8K0Y2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt33aQ8K0Y2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt33aQ8K0Y2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt33aQ8K0Y2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms