Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sh2d5Q8JZW5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Sh2d5Q8JZW5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sh2d5Q8JZW5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sh2d5Q8JZW5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sh2d5Q8JZW5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Sh2d5Q8JZW5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sh2d5Q8JZW5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sh2d5Q8JZW5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sh2d5Q8JZW5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sh2d5Q8JZW5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sh2d5Q8JZW5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sh2d5Q8JZW5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sh2d5Q8JZW5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sh2d5Q8JZW5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sh2d5Q8JZW5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sh2d5Q8JZW5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sh2d5Q8JZW5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sh2d5Q8JZW5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sh2d5Q8JZW5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sh2d5Q8JZW5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sh2d5Q8JZW5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sh2d5Q8JZW5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sh2d5Q8JZW5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sh2d5Q8JZW5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sh2d5Q8JZW5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sh2d5Q8JZW5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Sh2d5Q8JZW5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sh2d5Q8JZW5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sh2d5Q8JZW5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sh2d5Q8JZW5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sh2d5Q8JZW5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sh2d5Q8JZW5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sh2d5Q8JZW5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sh2d5Q8JZW5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sh2d5Q8JZW5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sh2d5Q8JZW5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sh2d5Q8JZW5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sh2d5Q8JZW5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sh2d5Q8JZW5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sh2d5Q8JZW5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sh2d5Q8JZW5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sh2d5Q8JZW5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Sh2d5Q8JZW5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Sh2d5Q8JZW5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sh2d5Q8JZW5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sh2d5Q8JZW5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sh2d5Q8JZW5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sh2d5Q8JZW5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sh2d5Q8JZW5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sh2d5Q8JZW5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sh2d5Q8JZW5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sh2d5Q8JZW5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Sh2d5Q8JZW5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sh2d5Q8JZW5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sh2d5Q8JZW5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sh2d5Q8JZW5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sh2d5Q8JZW5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sh2d5Q8JZW5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sh2d5Q8JZW5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sh2d5Q8JZW5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sh2d5Q8JZW5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sh2d5Q8JZW5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sh2d5Q8JZW5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sh2d5Q8JZW5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sh2d5Q8JZW5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Sh2d5Q8JZW5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sh2d5Q8JZW5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sh2d5Q8JZW5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sh2d5Q8JZW5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Sh2d5Q8JZW5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sh2d5Q8JZW5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sh2d5Q8JZW5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sh2d5Q8JZW5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sh2d5Q8JZW5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sh2d5Q8JZW5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Sh2d5Q8JZW5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sh2d5Q8JZW5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sh2d5Q8JZW5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sh2d5Q8JZW5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sh2d5Q8JZW5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sh2d5Q8JZW5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sh2d5Q8JZW5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sh2d5Q8JZW5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sh2d5Q8JZW5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sh2d5Q8JZW5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Sh2d5Q8JZW5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sh2d5Q8JZW5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sh2d5Q8JZW5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sh2d5Q8JZW5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sh2d5Q8JZW5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sh2d5Q8JZW5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sh2d5Q8JZW5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sh2d5Q8JZW5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sh2d5Q8JZW5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sh2d5Q8JZW5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Sh2d5Q8JZW5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sh2d5Q8JZW5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sh2d5Q8JZW5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sh2d5Q8JZW5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms