Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gpc3Q8CFZ4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gpc3Q8CFZ4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gpc3Q8CFZ4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gpc3Q8CFZ4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gpc3Q8CFZ4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gpc3Q8CFZ4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gpc3Q8CFZ4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gpc3Q8CFZ4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gpc3Q8CFZ4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gpc3Q8CFZ4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gpc3Q8CFZ4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gpc3Q8CFZ4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Gpc3Q8CFZ4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Gpc3Q8CFZ4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gpc3Q8CFZ4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gpc3Q8CFZ4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Gpc3Q8CFZ4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gpc3Q8CFZ4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gpc3Q8CFZ4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gpc3Q8CFZ4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gpc3Q8CFZ4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gpc3Q8CFZ4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gpc3Q8CFZ4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gpc3Q8CFZ4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gpc3Q8CFZ4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gpc3Q8CFZ4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gpc3Q8CFZ4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gpc3Q8CFZ4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gpc3Q8CFZ4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gpc3Q8CFZ4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gpc3Q8CFZ4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gpc3Q8CFZ4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gpc3Q8CFZ4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gpc3Q8CFZ4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gpc3Q8CFZ4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gpc3Q8CFZ4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gpc3Q8CFZ4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gpc3Q8CFZ4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gpc3Q8CFZ4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gpc3Q8CFZ4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Gpc3Q8CFZ4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gpc3Q8CFZ4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Gpc3Q8CFZ4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gpc3Q8CFZ4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gpc3Q8CFZ4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gpc3Q8CFZ4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gpc3Q8CFZ4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gpc3Q8CFZ4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gpc3Q8CFZ4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gpc3Q8CFZ4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Gpc3Q8CFZ4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gpc3Q8CFZ4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gpc3Q8CFZ4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gpc3Q8CFZ4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gpc3Q8CFZ4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gpc3Q8CFZ4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gpc3Q8CFZ4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gpc3Q8CFZ4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gpc3Q8CFZ4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gpc3Q8CFZ4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Gpc3Q8CFZ4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gpc3Q8CFZ4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gpc3Q8CFZ4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gpc3Q8CFZ4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gpc3Q8CFZ4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gpc3Q8CFZ4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gpc3Q8CFZ4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gpc3Q8CFZ4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gpc3Q8CFZ4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gpc3Q8CFZ4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gpc3Q8CFZ4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Gpc3Q8CFZ4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Gpc3Q8CFZ4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gpc3Q8CFZ4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gpc3Q8CFZ4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gpc3Q8CFZ4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gpc3Q8CFZ4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gpc3Q8CFZ4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gpc3Q8CFZ4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gpc3Q8CFZ4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gpc3Q8CFZ4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gpc3Q8CFZ4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gpc3Q8CFZ4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gpc3Q8CFZ4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gpc3Q8CFZ4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gpc3Q8CFZ4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gpc3Q8CFZ4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gpc3Q8CFZ4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gpc3Q8CFZ4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gpc3Q8CFZ4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Gpc3Q8CFZ4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gpc3Q8CFZ4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gpc3Q8CFZ4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gpc3Q8CFZ4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Gpc3Q8CFZ4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gpc3Q8CFZ4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gpc3Q8CFZ4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gpc3Q8CFZ4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gpc3Q8CFZ4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms