Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Nup88Q8CEC0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nup88Q8CEC0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Nup88Q8CEC0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Nup88Q8CEC0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nup88Q8CEC0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nup88Q8CEC0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nup88Q8CEC0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nup88Q8CEC0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nup88Q8CEC0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nup88Q8CEC0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nup88Q8CEC0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nup88Q8CEC0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nup88Q8CEC0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nup88Q8CEC0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nup88Q8CEC0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nup88Q8CEC0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nup88Q8CEC0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nup88Q8CEC0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Nup88Q8CEC0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nup88Q8CEC0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nup88Q8CEC0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nup88Q8CEC0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nup88Q8CEC0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Nup88Q8CEC0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nup88Q8CEC0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nup88Q8CEC0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nup88Q8CEC0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nup88Q8CEC0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nup88Q8CEC0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nup88Q8CEC0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nup88Q8CEC0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nup88Q8CEC0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nup88Q8CEC0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nup88Q8CEC0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nup88Q8CEC0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nup88Q8CEC0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nup88Q8CEC0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nup88Q8CEC0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nup88Q8CEC0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nup88Q8CEC0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Nup88Q8CEC0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nup88Q8CEC0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nup88Q8CEC0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nup88Q8CEC0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nup88Q8CEC0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Nup88Q8CEC0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nup88Q8CEC0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nup88Q8CEC0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nup88Q8CEC0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nup88Q8CEC0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nup88Q8CEC0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Nup88Q8CEC0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nup88Q8CEC0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nup88Q8CEC0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nup88Q8CEC0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nup88Q8CEC0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nup88Q8CEC0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nup88Q8CEC0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nup88Q8CEC0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nup88Q8CEC0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nup88Q8CEC0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nup88Q8CEC0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nup88Q8CEC0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nup88Q8CEC0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nup88Q8CEC0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nup88Q8CEC0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nup88Q8CEC0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nup88Q8CEC0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Nup88Q8CEC0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nup88Q8CEC0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nup88Q8CEC0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nup88Q8CEC0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nup88Q8CEC0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nup88Q8CEC0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nup88Q8CEC0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nup88Q8CEC0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nup88Q8CEC0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Nup88Q8CEC0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nup88Q8CEC0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nup88Q8CEC0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nup88Q8CEC0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nup88Q8CEC0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nup88Q8CEC0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nup88Q8CEC0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nup88Q8CEC0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nup88Q8CEC0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nup88Q8CEC0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nup88Q8CEC0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nup88Q8CEC0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Nup88Q8CEC0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Nup88Q8CEC0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nup88Q8CEC0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nup88Q8CEC0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nup88Q8CEC0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nup88Q8CEC0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nup88Q8CEC0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nup88Q8CEC0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nup88Q8CEC0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nup88Q8CEC0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms