Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAL5

Gpc5, Glypican-5, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc5Q8CAL5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gpc5Q8CAL5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gpc5Q8CAL5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Gpc5Q8CAL5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gpc5Q8CAL5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gpc5Q8CAL5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gpc5Q8CAL5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gpc5Q8CAL5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gpc5Q8CAL5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gpc5Q8CAL5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gpc5Q8CAL5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gpc5Q8CAL5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gpc5Q8CAL5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gpc5Q8CAL5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Gpc5Q8CAL5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Gpc5Q8CAL5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gpc5Q8CAL5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Gpc5Q8CAL5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gpc5Q8CAL5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Gpc5Q8CAL5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Gpc5Q8CAL5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gpc5Q8CAL5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gpc5Q8CAL5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gpc5Q8CAL5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gpc5Q8CAL5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gpc5Q8CAL5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Gpc5Q8CAL5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gpc5Q8CAL5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gpc5Q8CAL5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gpc5Q8CAL5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gpc5Q8CAL5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gpc5Q8CAL5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gpc5Q8CAL5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gpc5Q8CAL5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gpc5Q8CAL5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gpc5Q8CAL5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gpc5Q8CAL5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Gpc5Q8CAL5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gpc5Q8CAL5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gpc5Q8CAL5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gpc5Q8CAL5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Gpc5Q8CAL5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gpc5Q8CAL5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gpc5Q8CAL5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gpc5Q8CAL5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gpc5Q8CAL5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gpc5Q8CAL5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gpc5Q8CAL5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gpc5Q8CAL5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gpc5Q8CAL5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Gpc5Q8CAL5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gpc5Q8CAL5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gpc5Q8CAL5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gpc5Q8CAL5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Gpc5Q8CAL5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gpc5Q8CAL5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gpc5Q8CAL5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gpc5Q8CAL5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gpc5Q8CAL5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gpc5Q8CAL5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gpc5Q8CAL5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Gpc5Q8CAL5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gpc5Q8CAL5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gpc5Q8CAL5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gpc5Q8CAL5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gpc5Q8CAL5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gpc5Q8CAL5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gpc5Q8CAL5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gpc5Q8CAL5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gpc5Q8CAL5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gpc5Q8CAL5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Gpc5Q8CAL5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gpc5Q8CAL5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gpc5Q8CAL5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gpc5Q8CAL5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gpc5Q8CAL5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gpc5Q8CAL5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Gpc5Q8CAL5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gpc5Q8CAL5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gpc5Q8CAL5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Gpc5Q8CAL5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gpc5Q8CAL5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gpc5Q8CAL5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gpc5Q8CAL5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gpc5Q8CAL5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gpc5Q8CAL5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gpc5Q8CAL5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gpc5Q8CAL5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gpc5Q8CAL5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Gpc5Q8CAL5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gpc5Q8CAL5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gpc5Q8CAL5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gpc5Q8CAL5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gpc5Q8CAL5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gpc5Q8CAL5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gpc5Q8CAL5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gpc5Q8CAL5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gpc5Q8CAL5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gpc5Q8CAL5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gpc5Q8CAL5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms