Protein–RNA interactions for Protein: Q8C804

Spice1, Spindle and centriole-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spice1Q8C804 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Spice1Q8C804 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Spice1Q8C804 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Spice1Q8C804 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,05
Spice1Q8C804 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27,88■■■□□ 2,05
Spice1Q8C804 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Spice1Q8C804 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Spice1Q8C804 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27,87■■■□□ 2,05
Spice1Q8C804 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Spice1Q8C804 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27,86■■■□□ 2,05
Spice1Q8C804 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Spice1Q8C804 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,86■■■□□ 2,05
Spice1Q8C804 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Spice1Q8C804 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Spice1Q8C804 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27,82■■■□□ 2,04
Spice1Q8C804 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Spice1Q8C804 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Spice1Q8C804 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Spice1Q8C804 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Spice1Q8C804 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,79■■■□□ 2,04
Spice1Q8C804 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Spice1Q8C804 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Spice1Q8C804 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27,78■■■□□ 2,04
Spice1Q8C804 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Spice1Q8C804 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Spice1Q8C804 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Spice1Q8C804 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Spice1Q8C804 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Spice1Q8C804 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27,74■■■□□ 2,03
Spice1Q8C804 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Spice1Q8C804 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Spice1Q8C804 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27,7■■■□□ 2,02
Spice1Q8C804 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27,7■■■□□ 2,02
Spice1Q8C804 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27,7■■■□□ 2,02
Spice1Q8C804 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Spice1Q8C804 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Spice1Q8C804 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Spice1Q8C804 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Spice1Q8C804 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Spice1Q8C804 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Spice1Q8C804 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27,64■■■□□ 2,02
Spice1Q8C804 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Spice1Q8C804 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Spice1Q8C804 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Spice1Q8C804 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Spice1Q8C804 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Spice1Q8C804 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Spice1Q8C804 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Spice1Q8C804 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Spice1Q8C804 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Spice1Q8C804 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27,57■■■□□ 2
Spice1Q8C804 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Spice1Q8C804 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27,56■■■□□ 2
Spice1Q8C804 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Spice1Q8C804 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27,55■■■□□ 2
Spice1Q8C804 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27,55■■■□□ 2
Spice1Q8C804 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Spice1Q8C804 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Spice1Q8C804 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Spice1Q8C804 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Spice1Q8C804 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Spice1Q8C804 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Spice1Q8C804 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27,49■■□□□ 1,99
Spice1Q8C804 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Spice1Q8C804 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Spice1Q8C804 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Spice1Q8C804 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27,48■■□□□ 1,99
Spice1Q8C804 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27,48■■□□□ 1,99
Spice1Q8C804 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Spice1Q8C804 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Spice1Q8C804 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Spice1Q8C804 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Spice1Q8C804 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Spice1Q8C804 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Spice1Q8C804 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27,45■■□□□ 1,99
Spice1Q8C804 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Spice1Q8C804 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27,45■■□□□ 1,99
Spice1Q8C804 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Spice1Q8C804 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Spice1Q8C804 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Spice1Q8C804 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,44■■□□□ 1,98
Spice1Q8C804 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Spice1Q8C804 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Spice1Q8C804 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,42■■□□□ 1,98
Spice1Q8C804 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,4■■□□□ 1,98
Spice1Q8C804 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Spice1Q8C804 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,97
Spice1Q8C804 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27,38■■□□□ 1,97
Spice1Q8C804 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Spice1Q8C804 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Spice1Q8C804 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,37■■□□□ 1,97
Spice1Q8C804 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Spice1Q8C804 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Spice1Q8C804 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Spice1Q8C804 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27,35■■□□□ 1,97
Spice1Q8C804 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Spice1Q8C804 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Spice1Q8C804 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Spice1Q8C804 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Spice1Q8C804 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,5 ms