Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssuh2Q8C3L1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssuh2Q8C3L1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssuh2Q8C3L1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssuh2Q8C3L1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssuh2Q8C3L1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssuh2Q8C3L1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssuh2Q8C3L1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssuh2Q8C3L1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssuh2Q8C3L1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssuh2Q8C3L1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssuh2Q8C3L1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssuh2Q8C3L1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssuh2Q8C3L1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssuh2Q8C3L1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssuh2Q8C3L1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssuh2Q8C3L1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssuh2Q8C3L1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssuh2Q8C3L1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssuh2Q8C3L1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssuh2Q8C3L1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssuh2Q8C3L1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssuh2Q8C3L1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ssuh2Q8C3L1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ssuh2Q8C3L1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ssuh2Q8C3L1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ssuh2Q8C3L1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ssuh2Q8C3L1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ssuh2Q8C3L1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ssuh2Q8C3L1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ssuh2Q8C3L1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ssuh2Q8C3L1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ssuh2Q8C3L1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssuh2Q8C3L1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssuh2Q8C3L1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssuh2Q8C3L1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssuh2Q8C3L1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ssuh2Q8C3L1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ssuh2Q8C3L1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssuh2Q8C3L1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssuh2Q8C3L1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssuh2Q8C3L1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssuh2Q8C3L1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ssuh2Q8C3L1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ssuh2Q8C3L1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ssuh2Q8C3L1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ssuh2Q8C3L1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssuh2Q8C3L1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssuh2Q8C3L1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssuh2Q8C3L1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssuh2Q8C3L1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssuh2Q8C3L1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssuh2Q8C3L1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssuh2Q8C3L1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssuh2Q8C3L1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssuh2Q8C3L1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssuh2Q8C3L1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssuh2Q8C3L1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssuh2Q8C3L1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ssuh2Q8C3L1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssuh2Q8C3L1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssuh2Q8C3L1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssuh2Q8C3L1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssuh2Q8C3L1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssuh2Q8C3L1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssuh2Q8C3L1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ssuh2Q8C3L1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssuh2Q8C3L1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssuh2Q8C3L1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssuh2Q8C3L1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssuh2Q8C3L1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssuh2Q8C3L1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssuh2Q8C3L1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssuh2Q8C3L1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssuh2Q8C3L1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ssuh2Q8C3L1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssuh2Q8C3L1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssuh2Q8C3L1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssuh2Q8C3L1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssuh2Q8C3L1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssuh2Q8C3L1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssuh2Q8C3L1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssuh2Q8C3L1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssuh2Q8C3L1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssuh2Q8C3L1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssuh2Q8C3L1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssuh2Q8C3L1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssuh2Q8C3L1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssuh2Q8C3L1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssuh2Q8C3L1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssuh2Q8C3L1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssuh2Q8C3L1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssuh2Q8C3L1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssuh2Q8C3L1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ssuh2Q8C3L1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ssuh2Q8C3L1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms