Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B2

Tiparp, TCDD-inducible poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TiparpQ8C1B2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TiparpQ8C1B2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TiparpQ8C1B2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TiparpQ8C1B2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TiparpQ8C1B2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TiparpQ8C1B2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TiparpQ8C1B2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TiparpQ8C1B2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TiparpQ8C1B2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TiparpQ8C1B2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TiparpQ8C1B2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TiparpQ8C1B2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TiparpQ8C1B2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TiparpQ8C1B2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TiparpQ8C1B2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TiparpQ8C1B2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TiparpQ8C1B2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TiparpQ8C1B2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TiparpQ8C1B2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TiparpQ8C1B2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TiparpQ8C1B2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TiparpQ8C1B2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TiparpQ8C1B2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TiparpQ8C1B2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TiparpQ8C1B2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TiparpQ8C1B2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TiparpQ8C1B2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TiparpQ8C1B2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TiparpQ8C1B2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TiparpQ8C1B2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TiparpQ8C1B2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TiparpQ8C1B2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TiparpQ8C1B2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TiparpQ8C1B2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TiparpQ8C1B2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TiparpQ8C1B2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TiparpQ8C1B2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TiparpQ8C1B2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TiparpQ8C1B2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TiparpQ8C1B2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TiparpQ8C1B2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TiparpQ8C1B2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TiparpQ8C1B2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TiparpQ8C1B2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TiparpQ8C1B2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TiparpQ8C1B2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TiparpQ8C1B2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TiparpQ8C1B2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TiparpQ8C1B2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TiparpQ8C1B2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TiparpQ8C1B2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TiparpQ8C1B2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TiparpQ8C1B2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TiparpQ8C1B2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TiparpQ8C1B2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TiparpQ8C1B2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TiparpQ8C1B2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TiparpQ8C1B2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TiparpQ8C1B2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TiparpQ8C1B2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TiparpQ8C1B2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TiparpQ8C1B2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TiparpQ8C1B2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TiparpQ8C1B2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TiparpQ8C1B2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TiparpQ8C1B2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TiparpQ8C1B2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TiparpQ8C1B2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TiparpQ8C1B2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TiparpQ8C1B2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TiparpQ8C1B2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TiparpQ8C1B2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TiparpQ8C1B2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TiparpQ8C1B2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TiparpQ8C1B2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TiparpQ8C1B2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TiparpQ8C1B2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TiparpQ8C1B2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
TiparpQ8C1B2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TiparpQ8C1B2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TiparpQ8C1B2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TiparpQ8C1B2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TiparpQ8C1B2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TiparpQ8C1B2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TiparpQ8C1B2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TiparpQ8C1B2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TiparpQ8C1B2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TiparpQ8C1B2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TiparpQ8C1B2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TiparpQ8C1B2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TiparpQ8C1B2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TiparpQ8C1B2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TiparpQ8C1B2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TiparpQ8C1B2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TiparpQ8C1B2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TiparpQ8C1B2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TiparpQ8C1B2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TiparpQ8C1B2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TiparpQ8C1B2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TiparpQ8C1B2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms