Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfsfm13Q8BXS2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfsfm13Q8BXS2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfsfm13Q8BXS2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfsfm13Q8BXS2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfsfm13Q8BXS2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfsfm13Q8BXS2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfsfm13Q8BXS2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfsfm13Q8BXS2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms