Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRU4

Clec9a, C-type lectin domain family 9 member A, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec9aQ8BRU4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clec9aQ8BRU4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clec9aQ8BRU4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clec9aQ8BRU4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Clec9aQ8BRU4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clec9aQ8BRU4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clec9aQ8BRU4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clec9aQ8BRU4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clec9aQ8BRU4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clec9aQ8BRU4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clec9aQ8BRU4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clec9aQ8BRU4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clec9aQ8BRU4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clec9aQ8BRU4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clec9aQ8BRU4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clec9aQ8BRU4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clec9aQ8BRU4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clec9aQ8BRU4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clec9aQ8BRU4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clec9aQ8BRU4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clec9aQ8BRU4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clec9aQ8BRU4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clec9aQ8BRU4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clec9aQ8BRU4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clec9aQ8BRU4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clec9aQ8BRU4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clec9aQ8BRU4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clec9aQ8BRU4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clec9aQ8BRU4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clec9aQ8BRU4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clec9aQ8BRU4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clec9aQ8BRU4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clec9aQ8BRU4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clec9aQ8BRU4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec9aQ8BRU4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec9aQ8BRU4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec9aQ8BRU4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clec9aQ8BRU4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clec9aQ8BRU4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Clec9aQ8BRU4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clec9aQ8BRU4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec9aQ8BRU4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec9aQ8BRU4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec9aQ8BRU4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec9aQ8BRU4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec9aQ8BRU4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec9aQ8BRU4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Clec9aQ8BRU4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clec9aQ8BRU4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clec9aQ8BRU4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clec9aQ8BRU4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec9aQ8BRU4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec9aQ8BRU4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec9aQ8BRU4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec9aQ8BRU4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec9aQ8BRU4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec9aQ8BRU4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clec9aQ8BRU4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clec9aQ8BRU4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clec9aQ8BRU4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clec9aQ8BRU4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clec9aQ8BRU4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clec9aQ8BRU4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clec9aQ8BRU4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Clec9aQ8BRU4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clec9aQ8BRU4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clec9aQ8BRU4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec9aQ8BRU4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec9aQ8BRU4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec9aQ8BRU4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec9aQ8BRU4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clec9aQ8BRU4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clec9aQ8BRU4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clec9aQ8BRU4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clec9aQ8BRU4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Clec9aQ8BRU4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clec9aQ8BRU4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clec9aQ8BRU4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clec9aQ8BRU4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clec9aQ8BRU4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clec9aQ8BRU4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clec9aQ8BRU4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clec9aQ8BRU4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clec9aQ8BRU4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clec9aQ8BRU4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec9aQ8BRU4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec9aQ8BRU4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec9aQ8BRU4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec9aQ8BRU4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec9aQ8BRU4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec9aQ8BRU4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec9aQ8BRU4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec9aQ8BRU4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec9aQ8BRU4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec9aQ8BRU4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec9aQ8BRU4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec9aQ8BRU4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec9aQ8BRU4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec9aQ8BRU4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec9aQ8BRU4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms