Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF3

Me3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me3Q8BMF3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Me3Q8BMF3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Me3Q8BMF3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Me3Q8BMF3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Me3Q8BMF3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Me3Q8BMF3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Me3Q8BMF3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Me3Q8BMF3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Me3Q8BMF3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Me3Q8BMF3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Me3Q8BMF3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Me3Q8BMF3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Me3Q8BMF3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Me3Q8BMF3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Me3Q8BMF3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Me3Q8BMF3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Me3Q8BMF3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Me3Q8BMF3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Me3Q8BMF3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Me3Q8BMF3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Me3Q8BMF3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Me3Q8BMF3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Me3Q8BMF3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Me3Q8BMF3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Me3Q8BMF3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Me3Q8BMF3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Me3Q8BMF3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Me3Q8BMF3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Me3Q8BMF3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Me3Q8BMF3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Me3Q8BMF3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Me3Q8BMF3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Me3Q8BMF3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Me3Q8BMF3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Me3Q8BMF3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Me3Q8BMF3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Me3Q8BMF3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Me3Q8BMF3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Me3Q8BMF3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Me3Q8BMF3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Me3Q8BMF3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Me3Q8BMF3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Me3Q8BMF3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Me3Q8BMF3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Me3Q8BMF3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Me3Q8BMF3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Me3Q8BMF3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Me3Q8BMF3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Me3Q8BMF3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Me3Q8BMF3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Me3Q8BMF3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Me3Q8BMF3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Me3Q8BMF3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Me3Q8BMF3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Me3Q8BMF3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Me3Q8BMF3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Me3Q8BMF3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Me3Q8BMF3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Me3Q8BMF3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Me3Q8BMF3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Me3Q8BMF3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Me3Q8BMF3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Me3Q8BMF3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
Me3Q8BMF3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Me3Q8BMF3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Me3Q8BMF3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Me3Q8BMF3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Me3Q8BMF3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Me3Q8BMF3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Me3Q8BMF3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Me3Q8BMF3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Me3Q8BMF3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Me3Q8BMF3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Me3Q8BMF3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Me3Q8BMF3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Me3Q8BMF3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Me3Q8BMF3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Me3Q8BMF3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Me3Q8BMF3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Me3Q8BMF3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Me3Q8BMF3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Me3Q8BMF3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Me3Q8BMF3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Me3Q8BMF3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Me3Q8BMF3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Me3Q8BMF3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Me3Q8BMF3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Me3Q8BMF3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Me3Q8BMF3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Me3Q8BMF3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Me3Q8BMF3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Me3Q8BMF3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Me3Q8BMF3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Me3Q8BMF3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Me3Q8BMF3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Me3Q8BMF3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Me3Q8BMF3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Me3Q8BMF3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Me3Q8BMF3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Me3Q8BMF3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms