Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdca8Q8BHX3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdca8Q8BHX3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Cdca8Q8BHX3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cdca8Q8BHX3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cdca8Q8BHX3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cdca8Q8BHX3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cdca8Q8BHX3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdca8Q8BHX3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdca8Q8BHX3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cdca8Q8BHX3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cdca8Q8BHX3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdca8Q8BHX3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdca8Q8BHX3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdca8Q8BHX3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdca8Q8BHX3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdca8Q8BHX3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdca8Q8BHX3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdca8Q8BHX3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Cdca8Q8BHX3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cdca8Q8BHX3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdca8Q8BHX3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdca8Q8BHX3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdca8Q8BHX3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdca8Q8BHX3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdca8Q8BHX3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdca8Q8BHX3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdca8Q8BHX3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdca8Q8BHX3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdca8Q8BHX3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdca8Q8BHX3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdca8Q8BHX3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdca8Q8BHX3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdca8Q8BHX3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdca8Q8BHX3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cdca8Q8BHX3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cdca8Q8BHX3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cdca8Q8BHX3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cdca8Q8BHX3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cdca8Q8BHX3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cdca8Q8BHX3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdca8Q8BHX3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdca8Q8BHX3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdca8Q8BHX3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdca8Q8BHX3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdca8Q8BHX3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdca8Q8BHX3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cdca8Q8BHX3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cdca8Q8BHX3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Cdca8Q8BHX3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cdca8Q8BHX3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdca8Q8BHX3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdca8Q8BHX3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdca8Q8BHX3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdca8Q8BHX3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdca8Q8BHX3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdca8Q8BHX3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdca8Q8BHX3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdca8Q8BHX3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdca8Q8BHX3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdca8Q8BHX3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdca8Q8BHX3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdca8Q8BHX3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cdca8Q8BHX3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cdca8Q8BHX3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cdca8Q8BHX3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdca8Q8BHX3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdca8Q8BHX3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdca8Q8BHX3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cdca8Q8BHX3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cdca8Q8BHX3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdca8Q8BHX3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdca8Q8BHX3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdca8Q8BHX3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdca8Q8BHX3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdca8Q8BHX3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdca8Q8BHX3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cdca8Q8BHX3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cdca8Q8BHX3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cdca8Q8BHX3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cdca8Q8BHX3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdca8Q8BHX3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdca8Q8BHX3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdca8Q8BHX3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdca8Q8BHX3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdca8Q8BHX3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdca8Q8BHX3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdca8Q8BHX3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdca8Q8BHX3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdca8Q8BHX3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cdca8Q8BHX3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cdca8Q8BHX3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdca8Q8BHX3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdca8Q8BHX3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdca8Q8BHX3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdca8Q8BHX3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdca8Q8BHX3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdca8Q8BHX3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdca8Q8BHX3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdca8Q8BHX3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms