Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH74

Nup107, Nuclear pore complex protein Nup107, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup107Q8BH74 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup107Q8BH74 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup107Q8BH74 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup107Q8BH74 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup107Q8BH74 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup107Q8BH74 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup107Q8BH74 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup107Q8BH74 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup107Q8BH74 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup107Q8BH74 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup107Q8BH74 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup107Q8BH74 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup107Q8BH74 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup107Q8BH74 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nup107Q8BH74 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup107Q8BH74 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup107Q8BH74 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup107Q8BH74 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup107Q8BH74 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup107Q8BH74 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup107Q8BH74 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup107Q8BH74 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup107Q8BH74 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup107Q8BH74 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup107Q8BH74 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup107Q8BH74 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup107Q8BH74 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nup107Q8BH74 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nup107Q8BH74 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nup107Q8BH74 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nup107Q8BH74 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup107Q8BH74 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup107Q8BH74 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup107Q8BH74 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup107Q8BH74 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup107Q8BH74 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup107Q8BH74 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup107Q8BH74 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup107Q8BH74 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nup107Q8BH74 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nup107Q8BH74 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup107Q8BH74 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup107Q8BH74 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup107Q8BH74 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup107Q8BH74 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup107Q8BH74 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup107Q8BH74 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup107Q8BH74 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup107Q8BH74 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup107Q8BH74 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup107Q8BH74 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup107Q8BH74 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup107Q8BH74 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup107Q8BH74 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup107Q8BH74 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup107Q8BH74 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup107Q8BH74 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup107Q8BH74 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup107Q8BH74 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup107Q8BH74 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup107Q8BH74 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup107Q8BH74 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup107Q8BH74 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup107Q8BH74 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup107Q8BH74 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup107Q8BH74 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup107Q8BH74 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup107Q8BH74 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup107Q8BH74 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup107Q8BH74 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup107Q8BH74 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup107Q8BH74 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup107Q8BH74 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup107Q8BH74 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup107Q8BH74 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup107Q8BH74 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup107Q8BH74 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup107Q8BH74 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup107Q8BH74 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup107Q8BH74 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup107Q8BH74 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nup107Q8BH74 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nup107Q8BH74 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup107Q8BH74 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup107Q8BH74 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup107Q8BH74 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup107Q8BH74 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup107Q8BH74 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup107Q8BH74 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup107Q8BH74 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup107Q8BH74 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup107Q8BH74 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup107Q8BH74 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup107Q8BH74 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup107Q8BH74 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup107Q8BH74 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup107Q8BH74 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nup107Q8BH74 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup107Q8BH74 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup107Q8BH74 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms