Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH66

Atl1, Atlastin-1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl1Q8BH66 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atl1Q8BH66 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atl1Q8BH66 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atl1Q8BH66 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Atl1Q8BH66 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atl1Q8BH66 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atl1Q8BH66 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atl1Q8BH66 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atl1Q8BH66 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atl1Q8BH66 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atl1Q8BH66 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atl1Q8BH66 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atl1Q8BH66 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atl1Q8BH66 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atl1Q8BH66 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atl1Q8BH66 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atl1Q8BH66 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atl1Q8BH66 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atl1Q8BH66 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atl1Q8BH66 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atl1Q8BH66 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Atl1Q8BH66 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atl1Q8BH66 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atl1Q8BH66 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atl1Q8BH66 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atl1Q8BH66 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atl1Q8BH66 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atl1Q8BH66 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atl1Q8BH66 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atl1Q8BH66 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atl1Q8BH66 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atl1Q8BH66 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atl1Q8BH66 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atl1Q8BH66 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atl1Q8BH66 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Atl1Q8BH66 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atl1Q8BH66 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atl1Q8BH66 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atl1Q8BH66 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atl1Q8BH66 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Atl1Q8BH66 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atl1Q8BH66 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atl1Q8BH66 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atl1Q8BH66 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atl1Q8BH66 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atl1Q8BH66 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atl1Q8BH66 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atl1Q8BH66 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atl1Q8BH66 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atl1Q8BH66 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atl1Q8BH66 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atl1Q8BH66 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atl1Q8BH66 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atl1Q8BH66 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atl1Q8BH66 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atl1Q8BH66 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atl1Q8BH66 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atl1Q8BH66 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atl1Q8BH66 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atl1Q8BH66 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atl1Q8BH66 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atl1Q8BH66 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atl1Q8BH66 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atl1Q8BH66 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atl1Q8BH66 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atl1Q8BH66 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atl1Q8BH66 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atl1Q8BH66 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atl1Q8BH66 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atl1Q8BH66 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atl1Q8BH66 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atl1Q8BH66 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atl1Q8BH66 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atl1Q8BH66 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Atl1Q8BH66 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atl1Q8BH66 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atl1Q8BH66 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atl1Q8BH66 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atl1Q8BH66 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atl1Q8BH66 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atl1Q8BH66 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atl1Q8BH66 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atl1Q8BH66 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atl1Q8BH66 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atl1Q8BH66 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atl1Q8BH66 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atl1Q8BH66 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atl1Q8BH66 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atl1Q8BH66 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atl1Q8BH66 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atl1Q8BH66 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Atl1Q8BH66 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atl1Q8BH66 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atl1Q8BH66 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atl1Q8BH66 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atl1Q8BH66 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atl1Q8BH66 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atl1Q8BH66 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Atl1Q8BH66 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atl1Q8BH66 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms