Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cyp4f39Q8BGU0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cyp4f39Q8BGU0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cyp4f39Q8BGU0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cyp4f39Q8BGU0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cyp4f39Q8BGU0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cyp4f39Q8BGU0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cyp4f39Q8BGU0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Cyp4f39Q8BGU0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cyp4f39Q8BGU0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cyp4f39Q8BGU0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cyp4f39Q8BGU0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cyp4f39Q8BGU0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cyp4f39Q8BGU0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cyp4f39Q8BGU0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cyp4f39Q8BGU0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cyp4f39Q8BGU0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cyp4f39Q8BGU0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cyp4f39Q8BGU0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cyp4f39Q8BGU0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cyp4f39Q8BGU0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Cyp4f39Q8BGU0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cyp4f39Q8BGU0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cyp4f39Q8BGU0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cyp4f39Q8BGU0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cyp4f39Q8BGU0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cyp4f39Q8BGU0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cyp4f39Q8BGU0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cyp4f39Q8BGU0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cyp4f39Q8BGU0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cyp4f39Q8BGU0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cyp4f39Q8BGU0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cyp4f39Q8BGU0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cyp4f39Q8BGU0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cyp4f39Q8BGU0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Cyp4f39Q8BGU0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cyp4f39Q8BGU0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cyp4f39Q8BGU0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cyp4f39Q8BGU0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cyp4f39Q8BGU0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cyp4f39Q8BGU0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cyp4f39Q8BGU0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cyp4f39Q8BGU0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cyp4f39Q8BGU0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cyp4f39Q8BGU0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cyp4f39Q8BGU0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cyp4f39Q8BGU0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cyp4f39Q8BGU0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cyp4f39Q8BGU0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cyp4f39Q8BGU0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cyp4f39Q8BGU0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cyp4f39Q8BGU0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cyp4f39Q8BGU0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cyp4f39Q8BGU0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cyp4f39Q8BGU0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cyp4f39Q8BGU0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cyp4f39Q8BGU0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cyp4f39Q8BGU0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cyp4f39Q8BGU0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cyp4f39Q8BGU0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cyp4f39Q8BGU0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cyp4f39Q8BGU0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cyp4f39Q8BGU0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cyp4f39Q8BGU0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cyp4f39Q8BGU0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cyp4f39Q8BGU0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cyp4f39Q8BGU0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cyp4f39Q8BGU0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cyp4f39Q8BGU0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cyp4f39Q8BGU0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cyp4f39Q8BGU0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cyp4f39Q8BGU0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cyp4f39Q8BGU0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cyp4f39Q8BGU0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Cyp4f39Q8BGU0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cyp4f39Q8BGU0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cyp4f39Q8BGU0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cyp4f39Q8BGU0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cyp4f39Q8BGU0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cyp4f39Q8BGU0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cyp4f39Q8BGU0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cyp4f39Q8BGU0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cyp4f39Q8BGU0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cyp4f39Q8BGU0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cyp4f39Q8BGU0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cyp4f39Q8BGU0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cyp4f39Q8BGU0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Cyp4f39Q8BGU0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cyp4f39Q8BGU0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cyp4f39Q8BGU0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms