Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
U2af1l4Q8BGJ9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
U2af1l4Q8BGJ9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
U2af1l4Q8BGJ9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
U2af1l4Q8BGJ9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
U2af1l4Q8BGJ9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
U2af1l4Q8BGJ9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
U2af1l4Q8BGJ9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
U2af1l4Q8BGJ9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
U2af1l4Q8BGJ9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
U2af1l4Q8BGJ9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
U2af1l4Q8BGJ9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
U2af1l4Q8BGJ9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
U2af1l4Q8BGJ9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
U2af1l4Q8BGJ9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
U2af1l4Q8BGJ9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
U2af1l4Q8BGJ9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
U2af1l4Q8BGJ9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
U2af1l4Q8BGJ9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
U2af1l4Q8BGJ9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
U2af1l4Q8BGJ9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
U2af1l4Q8BGJ9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
U2af1l4Q8BGJ9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
U2af1l4Q8BGJ9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
U2af1l4Q8BGJ9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
U2af1l4Q8BGJ9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
U2af1l4Q8BGJ9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
U2af1l4Q8BGJ9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
U2af1l4Q8BGJ9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
U2af1l4Q8BGJ9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
U2af1l4Q8BGJ9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
U2af1l4Q8BGJ9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
U2af1l4Q8BGJ9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
U2af1l4Q8BGJ9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
U2af1l4Q8BGJ9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
U2af1l4Q8BGJ9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
U2af1l4Q8BGJ9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
U2af1l4Q8BGJ9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
U2af1l4Q8BGJ9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
U2af1l4Q8BGJ9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
U2af1l4Q8BGJ9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
U2af1l4Q8BGJ9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
U2af1l4Q8BGJ9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
U2af1l4Q8BGJ9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
U2af1l4Q8BGJ9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
U2af1l4Q8BGJ9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
U2af1l4Q8BGJ9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
U2af1l4Q8BGJ9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
U2af1l4Q8BGJ9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
U2af1l4Q8BGJ9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
U2af1l4Q8BGJ9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
U2af1l4Q8BGJ9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
U2af1l4Q8BGJ9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
U2af1l4Q8BGJ9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
U2af1l4Q8BGJ9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
U2af1l4Q8BGJ9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
U2af1l4Q8BGJ9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
U2af1l4Q8BGJ9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
U2af1l4Q8BGJ9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
U2af1l4Q8BGJ9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
U2af1l4Q8BGJ9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
U2af1l4Q8BGJ9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
U2af1l4Q8BGJ9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
U2af1l4Q8BGJ9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
U2af1l4Q8BGJ9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
U2af1l4Q8BGJ9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
U2af1l4Q8BGJ9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
U2af1l4Q8BGJ9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
U2af1l4Q8BGJ9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
U2af1l4Q8BGJ9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
U2af1l4Q8BGJ9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
U2af1l4Q8BGJ9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
U2af1l4Q8BGJ9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
U2af1l4Q8BGJ9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
U2af1l4Q8BGJ9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
U2af1l4Q8BGJ9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
U2af1l4Q8BGJ9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
U2af1l4Q8BGJ9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
U2af1l4Q8BGJ9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
U2af1l4Q8BGJ9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
U2af1l4Q8BGJ9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
U2af1l4Q8BGJ9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
U2af1l4Q8BGJ9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
U2af1l4Q8BGJ9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
U2af1l4Q8BGJ9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
U2af1l4Q8BGJ9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
U2af1l4Q8BGJ9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
U2af1l4Q8BGJ9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
U2af1l4Q8BGJ9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
U2af1l4Q8BGJ9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
U2af1l4Q8BGJ9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
U2af1l4Q8BGJ9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
U2af1l4Q8BGJ9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
U2af1l4Q8BGJ9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
U2af1l4Q8BGJ9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
U2af1l4Q8BGJ9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
U2af1l4Q8BGJ9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
U2af1l4Q8BGJ9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
U2af1l4Q8BGJ9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms