Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD2

A730061H03Rik, RIKEN cDNA A730061H03 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A730061H03RikQ8BGD2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A730061H03RikQ8BGD2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A730061H03RikQ8BGD2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A730061H03RikQ8BGD2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A730061H03RikQ8BGD2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A730061H03RikQ8BGD2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A730061H03RikQ8BGD2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A730061H03RikQ8BGD2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A730061H03RikQ8BGD2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A730061H03RikQ8BGD2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A730061H03RikQ8BGD2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A730061H03RikQ8BGD2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
A730061H03RikQ8BGD2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
A730061H03RikQ8BGD2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A730061H03RikQ8BGD2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A730061H03RikQ8BGD2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A730061H03RikQ8BGD2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A730061H03RikQ8BGD2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A730061H03RikQ8BGD2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
A730061H03RikQ8BGD2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A730061H03RikQ8BGD2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A730061H03RikQ8BGD2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A730061H03RikQ8BGD2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A730061H03RikQ8BGD2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A730061H03RikQ8BGD2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A730061H03RikQ8BGD2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A730061H03RikQ8BGD2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A730061H03RikQ8BGD2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A730061H03RikQ8BGD2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A730061H03RikQ8BGD2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A730061H03RikQ8BGD2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A730061H03RikQ8BGD2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A730061H03RikQ8BGD2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A730061H03RikQ8BGD2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A730061H03RikQ8BGD2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A730061H03RikQ8BGD2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A730061H03RikQ8BGD2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A730061H03RikQ8BGD2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A730061H03RikQ8BGD2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A730061H03RikQ8BGD2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A730061H03RikQ8BGD2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A730061H03RikQ8BGD2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A730061H03RikQ8BGD2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A730061H03RikQ8BGD2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
A730061H03RikQ8BGD2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A730061H03RikQ8BGD2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A730061H03RikQ8BGD2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A730061H03RikQ8BGD2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A730061H03RikQ8BGD2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A730061H03RikQ8BGD2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A730061H03RikQ8BGD2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A730061H03RikQ8BGD2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A730061H03RikQ8BGD2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A730061H03RikQ8BGD2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A730061H03RikQ8BGD2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A730061H03RikQ8BGD2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A730061H03RikQ8BGD2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A730061H03RikQ8BGD2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A730061H03RikQ8BGD2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A730061H03RikQ8BGD2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A730061H03RikQ8BGD2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A730061H03RikQ8BGD2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A730061H03RikQ8BGD2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A730061H03RikQ8BGD2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A730061H03RikQ8BGD2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A730061H03RikQ8BGD2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A730061H03RikQ8BGD2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A730061H03RikQ8BGD2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A730061H03RikQ8BGD2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A730061H03RikQ8BGD2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A730061H03RikQ8BGD2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A730061H03RikQ8BGD2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A730061H03RikQ8BGD2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A730061H03RikQ8BGD2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A730061H03RikQ8BGD2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A730061H03RikQ8BGD2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A730061H03RikQ8BGD2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A730061H03RikQ8BGD2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
A730061H03RikQ8BGD2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A730061H03RikQ8BGD2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A730061H03RikQ8BGD2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A730061H03RikQ8BGD2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A730061H03RikQ8BGD2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A730061H03RikQ8BGD2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A730061H03RikQ8BGD2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A730061H03RikQ8BGD2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A730061H03RikQ8BGD2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A730061H03RikQ8BGD2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A730061H03RikQ8BGD2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A730061H03RikQ8BGD2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A730061H03RikQ8BGD2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A730061H03RikQ8BGD2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A730061H03RikQ8BGD2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A730061H03RikQ8BGD2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A730061H03RikQ8BGD2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A730061H03RikQ8BGD2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
A730061H03RikQ8BGD2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A730061H03RikQ8BGD2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A730061H03RikQ8BGD2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A730061H03RikQ8BGD2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms