Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG19

Tmtc4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc4Q8BG19 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmtc4Q8BG19 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tmtc4Q8BG19 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmtc4Q8BG19 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmtc4Q8BG19 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmtc4Q8BG19 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmtc4Q8BG19 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmtc4Q8BG19 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmtc4Q8BG19 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmtc4Q8BG19 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmtc4Q8BG19 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmtc4Q8BG19 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmtc4Q8BG19 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmtc4Q8BG19 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmtc4Q8BG19 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmtc4Q8BG19 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmtc4Q8BG19 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmtc4Q8BG19 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmtc4Q8BG19 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmtc4Q8BG19 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmtc4Q8BG19 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmtc4Q8BG19 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmtc4Q8BG19 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmtc4Q8BG19 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmtc4Q8BG19 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmtc4Q8BG19 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmtc4Q8BG19 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmtc4Q8BG19 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmtc4Q8BG19 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmtc4Q8BG19 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmtc4Q8BG19 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmtc4Q8BG19 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmtc4Q8BG19 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmtc4Q8BG19 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmtc4Q8BG19 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmtc4Q8BG19 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmtc4Q8BG19 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmtc4Q8BG19 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmtc4Q8BG19 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmtc4Q8BG19 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmtc4Q8BG19 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmtc4Q8BG19 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmtc4Q8BG19 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmtc4Q8BG19 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmtc4Q8BG19 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmtc4Q8BG19 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmtc4Q8BG19 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmtc4Q8BG19 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmtc4Q8BG19 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmtc4Q8BG19 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmtc4Q8BG19 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmtc4Q8BG19 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmtc4Q8BG19 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmtc4Q8BG19 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmtc4Q8BG19 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmtc4Q8BG19 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmtc4Q8BG19 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmtc4Q8BG19 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmtc4Q8BG19 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmtc4Q8BG19 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmtc4Q8BG19 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmtc4Q8BG19 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmtc4Q8BG19 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmtc4Q8BG19 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmtc4Q8BG19 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmtc4Q8BG19 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmtc4Q8BG19 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmtc4Q8BG19 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tmtc4Q8BG19 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmtc4Q8BG19 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmtc4Q8BG19 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmtc4Q8BG19 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmtc4Q8BG19 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmtc4Q8BG19 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmtc4Q8BG19 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmtc4Q8BG19 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmtc4Q8BG19 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmtc4Q8BG19 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmtc4Q8BG19 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Tmtc4Q8BG19 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmtc4Q8BG19 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmtc4Q8BG19 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmtc4Q8BG19 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmtc4Q8BG19 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmtc4Q8BG19 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmtc4Q8BG19 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmtc4Q8BG19 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmtc4Q8BG19 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmtc4Q8BG19 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmtc4Q8BG19 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmtc4Q8BG19 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmtc4Q8BG19 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmtc4Q8BG19 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmtc4Q8BG19 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmtc4Q8BG19 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmtc4Q8BG19 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmtc4Q8BG19 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmtc4Q8BG19 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmtc4Q8BG19 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmtc4Q8BG19 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 445.9 ms