Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG16

Slc6a15, Sodium-dependent neutral amino acid transporter B(0)AT2, mousemouse

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a15Q8BG16 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc6a15Q8BG16 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc6a15Q8BG16 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc6a15Q8BG16 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc6a15Q8BG16 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc6a15Q8BG16 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc6a15Q8BG16 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc6a15Q8BG16 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc6a15Q8BG16 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc6a15Q8BG16 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc6a15Q8BG16 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc6a15Q8BG16 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc6a15Q8BG16 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc6a15Q8BG16 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc6a15Q8BG16 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc6a15Q8BG16 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc6a15Q8BG16 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc6a15Q8BG16 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc6a15Q8BG16 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc6a15Q8BG16 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc6a15Q8BG16 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc6a15Q8BG16 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc6a15Q8BG16 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc6a15Q8BG16 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc6a15Q8BG16 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc6a15Q8BG16 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc6a15Q8BG16 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc6a15Q8BG16 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc6a15Q8BG16 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc6a15Q8BG16 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc6a15Q8BG16 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc6a15Q8BG16 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc6a15Q8BG16 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc6a15Q8BG16 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc6a15Q8BG16 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc6a15Q8BG16 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc6a15Q8BG16 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc6a15Q8BG16 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc6a15Q8BG16 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc6a15Q8BG16 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc6a15Q8BG16 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc6a15Q8BG16 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc6a15Q8BG16 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc6a15Q8BG16 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc6a15Q8BG16 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc6a15Q8BG16 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc6a15Q8BG16 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc6a15Q8BG16 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc6a15Q8BG16 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc6a15Q8BG16 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc6a15Q8BG16 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc6a15Q8BG16 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc6a15Q8BG16 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc6a15Q8BG16 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc6a15Q8BG16 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc6a15Q8BG16 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc6a15Q8BG16 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc6a15Q8BG16 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc6a15Q8BG16 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc6a15Q8BG16 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc6a15Q8BG16 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc6a15Q8BG16 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc6a15Q8BG16 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc6a15Q8BG16 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc6a15Q8BG16 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc6a15Q8BG16 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc6a15Q8BG16 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc6a15Q8BG16 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc6a15Q8BG16 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc6a15Q8BG16 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc6a15Q8BG16 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc6a15Q8BG16 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc6a15Q8BG16 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc6a15Q8BG16 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc6a15Q8BG16 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc6a15Q8BG16 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc6a15Q8BG16 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc6a15Q8BG16 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc6a15Q8BG16 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc6a15Q8BG16 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc6a15Q8BG16 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc6a15Q8BG16 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc6a15Q8BG16 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc6a15Q8BG16 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc6a15Q8BG16 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc6a15Q8BG16 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc6a15Q8BG16 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc6a15Q8BG16 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc6a15Q8BG16 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc6a15Q8BG16 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc6a15Q8BG16 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc6a15Q8BG16 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc6a15Q8BG16 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc6a15Q8BG16 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc6a15Q8BG16 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc6a15Q8BG16 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc6a15Q8BG16 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc6a15Q8BG16 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc6a15Q8BG16 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc6a15Q8BG16 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms