Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ctdspl2Q8BG15 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ctdspl2Q8BG15 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ctdspl2Q8BG15 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ctdspl2Q8BG15 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ctdspl2Q8BG15 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ctdspl2Q8BG15 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ctdspl2Q8BG15 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ctdspl2Q8BG15 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ctdspl2Q8BG15 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ctdspl2Q8BG15 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ctdspl2Q8BG15 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ctdspl2Q8BG15 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ctdspl2Q8BG15 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ctdspl2Q8BG15 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ctdspl2Q8BG15 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ctdspl2Q8BG15 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ctdspl2Q8BG15 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ctdspl2Q8BG15 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Ctdspl2Q8BG15 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ctdspl2Q8BG15 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Ctdspl2Q8BG15 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ctdspl2Q8BG15 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ctdspl2Q8BG15 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ctdspl2Q8BG15 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ctdspl2Q8BG15 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Ctdspl2Q8BG15 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ctdspl2Q8BG15 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ctdspl2Q8BG15 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ctdspl2Q8BG15 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ctdspl2Q8BG15 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ctdspl2Q8BG15 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ctdspl2Q8BG15 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ctdspl2Q8BG15 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ctdspl2Q8BG15 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ctdspl2Q8BG15 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ctdspl2Q8BG15 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ctdspl2Q8BG15 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ctdspl2Q8BG15 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ctdspl2Q8BG15 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ctdspl2Q8BG15 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ctdspl2Q8BG15 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ctdspl2Q8BG15 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ctdspl2Q8BG15 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ctdspl2Q8BG15 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ctdspl2Q8BG15 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ctdspl2Q8BG15 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ctdspl2Q8BG15 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ctdspl2Q8BG15 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ctdspl2Q8BG15 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ctdspl2Q8BG15 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ctdspl2Q8BG15 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ctdspl2Q8BG15 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ctdspl2Q8BG15 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ctdspl2Q8BG15 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ctdspl2Q8BG15 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ctdspl2Q8BG15 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Ctdspl2Q8BG15 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ctdspl2Q8BG15 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ctdspl2Q8BG15 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ctdspl2Q8BG15 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ctdspl2Q8BG15 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ctdspl2Q8BG15 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ctdspl2Q8BG15 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ctdspl2Q8BG15 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ctdspl2Q8BG15 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ctdspl2Q8BG15 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ctdspl2Q8BG15 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ctdspl2Q8BG15 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ctdspl2Q8BG15 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ctdspl2Q8BG15 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ctdspl2Q8BG15 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ctdspl2Q8BG15 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ctdspl2Q8BG15 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ctdspl2Q8BG15 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ctdspl2Q8BG15 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ctdspl2Q8BG15 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ctdspl2Q8BG15 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ctdspl2Q8BG15 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ctdspl2Q8BG15 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ctdspl2Q8BG15 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ctdspl2Q8BG15 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ctdspl2Q8BG15 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ctdspl2Q8BG15 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ctdspl2Q8BG15 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ctdspl2Q8BG15 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ctdspl2Q8BG15 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ctdspl2Q8BG15 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ctdspl2Q8BG15 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ctdspl2Q8BG15 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ctdspl2Q8BG15 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ctdspl2Q8BG15 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ctdspl2Q8BG15 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ctdspl2Q8BG15 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ctdspl2Q8BG15 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ctdspl2Q8BG15 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Ctdspl2Q8BG15 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ctdspl2Q8BG15 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ctdspl2Q8BG15 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ctdspl2Q8BG15 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms