Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cracr2bQ80ZJ8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Cracr2bQ80ZJ8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cracr2bQ80ZJ8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cracr2bQ80ZJ8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cracr2bQ80ZJ8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cracr2bQ80ZJ8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cracr2bQ80ZJ8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cracr2bQ80ZJ8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cracr2bQ80ZJ8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cracr2bQ80ZJ8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cracr2bQ80ZJ8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cracr2bQ80ZJ8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Cracr2bQ80ZJ8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cracr2bQ80ZJ8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cracr2bQ80ZJ8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cracr2bQ80ZJ8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cracr2bQ80ZJ8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cracr2bQ80ZJ8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cracr2bQ80ZJ8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Cracr2bQ80ZJ8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Cracr2bQ80ZJ8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cracr2bQ80ZJ8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Cracr2bQ80ZJ8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cracr2bQ80ZJ8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cracr2bQ80ZJ8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cracr2bQ80ZJ8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cracr2bQ80ZJ8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cracr2bQ80ZJ8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Cracr2bQ80ZJ8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cracr2bQ80ZJ8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cracr2bQ80ZJ8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cracr2bQ80ZJ8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cracr2bQ80ZJ8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Cracr2bQ80ZJ8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cracr2bQ80ZJ8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cracr2bQ80ZJ8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cracr2bQ80ZJ8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cracr2bQ80ZJ8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cracr2bQ80ZJ8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Cracr2bQ80ZJ8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cracr2bQ80ZJ8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cracr2bQ80ZJ8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cracr2bQ80ZJ8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cracr2bQ80ZJ8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cracr2bQ80ZJ8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cracr2bQ80ZJ8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cracr2bQ80ZJ8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cracr2bQ80ZJ8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cracr2bQ80ZJ8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cracr2bQ80ZJ8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cracr2bQ80ZJ8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cracr2bQ80ZJ8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cracr2bQ80ZJ8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cracr2bQ80ZJ8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Cracr2bQ80ZJ8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cracr2bQ80ZJ8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cracr2bQ80ZJ8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cracr2bQ80ZJ8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cracr2bQ80ZJ8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cracr2bQ80ZJ8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cracr2bQ80ZJ8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cracr2bQ80ZJ8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cracr2bQ80ZJ8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cracr2bQ80ZJ8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cracr2bQ80ZJ8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cracr2bQ80ZJ8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cracr2bQ80ZJ8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cracr2bQ80ZJ8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cracr2bQ80ZJ8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cracr2bQ80ZJ8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cracr2bQ80ZJ8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cracr2bQ80ZJ8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cracr2bQ80ZJ8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cracr2bQ80ZJ8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cracr2bQ80ZJ8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cracr2bQ80ZJ8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cracr2bQ80ZJ8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cracr2bQ80ZJ8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Cracr2bQ80ZJ8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cracr2bQ80ZJ8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cracr2bQ80ZJ8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cracr2bQ80ZJ8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cracr2bQ80ZJ8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cracr2bQ80ZJ8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cracr2bQ80ZJ8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cracr2bQ80ZJ8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Cracr2bQ80ZJ8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cracr2bQ80ZJ8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Cracr2bQ80ZJ8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cracr2bQ80ZJ8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cracr2bQ80ZJ8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms