Protein–RNA interactions for Protein: Q80XI4

Pip4k2b, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4k2bQ80XI4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Pip4k2bQ80XI4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Pip4k2bQ80XI4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Pip4k2bQ80XI4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
Pip4k2bQ80XI4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Pip4k2bQ80XI4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Pip4k2bQ80XI4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Pip4k2bQ80XI4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
Pip4k2bQ80XI4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Pip4k2bQ80XI4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Pip4k2bQ80XI4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
Pip4k2bQ80XI4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Pip4k2bQ80XI4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Pip4k2bQ80XI4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Pip4k2bQ80XI4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Pip4k2bQ80XI4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
Pip4k2bQ80XI4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Pip4k2bQ80XI4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Pip4k2bQ80XI4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Pip4k2bQ80XI4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Pip4k2bQ80XI4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Pip4k2bQ80XI4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
Pip4k2bQ80XI4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Pip4k2bQ80XI4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Pip4k2bQ80XI4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
Pip4k2bQ80XI4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Pip4k2bQ80XI4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Pip4k2bQ80XI4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Pip4k2bQ80XI4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Pip4k2bQ80XI4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
Pip4k2bQ80XI4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Pip4k2bQ80XI4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Pip4k2bQ80XI4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Pip4k2bQ80XI4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Pip4k2bQ80XI4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Pip4k2bQ80XI4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Pip4k2bQ80XI4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Pip4k2bQ80XI4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Pip4k2bQ80XI4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Pip4k2bQ80XI4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Pip4k2bQ80XI4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Pip4k2bQ80XI4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Pip4k2bQ80XI4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Pip4k2bQ80XI4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Pip4k2bQ80XI4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Pip4k2bQ80XI4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Pip4k2bQ80XI4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
Pip4k2bQ80XI4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
Pip4k2bQ80XI4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Pip4k2bQ80XI4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Pip4k2bQ80XI4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Pip4k2bQ80XI4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Pip4k2bQ80XI4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Pip4k2bQ80XI4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Pip4k2bQ80XI4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Pip4k2bQ80XI4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Pip4k2bQ80XI4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
Pip4k2bQ80XI4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
Pip4k2bQ80XI4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Pip4k2bQ80XI4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Pip4k2bQ80XI4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Pip4k2bQ80XI4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Pip4k2bQ80XI4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Pip4k2bQ80XI4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Pip4k2bQ80XI4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Pip4k2bQ80XI4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Pip4k2bQ80XI4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Pip4k2bQ80XI4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Pip4k2bQ80XI4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Pip4k2bQ80XI4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Pip4k2bQ80XI4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Pip4k2bQ80XI4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Pip4k2bQ80XI4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Pip4k2bQ80XI4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Pip4k2bQ80XI4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Pip4k2bQ80XI4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Pip4k2bQ80XI4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Pip4k2bQ80XI4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Pip4k2bQ80XI4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Pip4k2bQ80XI4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Pip4k2bQ80XI4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Pip4k2bQ80XI4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Pip4k2bQ80XI4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Pip4k2bQ80XI4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Pip4k2bQ80XI4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Pip4k2bQ80XI4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Pip4k2bQ80XI4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Pip4k2bQ80XI4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Pip4k2bQ80XI4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Pip4k2bQ80XI4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Pip4k2bQ80XI4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Pip4k2bQ80XI4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Pip4k2bQ80XI4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Pip4k2bQ80XI4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Pip4k2bQ80XI4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Pip4k2bQ80XI4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Pip4k2bQ80XI4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Pip4k2bQ80XI4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Pip4k2bQ80XI4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Pip4k2bQ80XI4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms