Protein–RNA interactions for Protein: Q80X53

Ccdc116, Coiled-coil domain-containing protein 116, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc116Q80X53 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc116Q80X53 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc116Q80X53 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc116Q80X53 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc116Q80X53 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc116Q80X53 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc116Q80X53 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc116Q80X53 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc116Q80X53 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc116Q80X53 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc116Q80X53 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc116Q80X53 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc116Q80X53 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc116Q80X53 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc116Q80X53 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc116Q80X53 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc116Q80X53 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc116Q80X53 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc116Q80X53 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc116Q80X53 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc116Q80X53 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc116Q80X53 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc116Q80X53 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc116Q80X53 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc116Q80X53 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc116Q80X53 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc116Q80X53 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc116Q80X53 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc116Q80X53 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc116Q80X53 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc116Q80X53 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc116Q80X53 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc116Q80X53 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc116Q80X53 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc116Q80X53 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc116Q80X53 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc116Q80X53 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc116Q80X53 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc116Q80X53 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc116Q80X53 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc116Q80X53 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc116Q80X53 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc116Q80X53 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc116Q80X53 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc116Q80X53 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc116Q80X53 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc116Q80X53 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc116Q80X53 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc116Q80X53 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc116Q80X53 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc116Q80X53 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc116Q80X53 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc116Q80X53 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc116Q80X53 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc116Q80X53 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc116Q80X53 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc116Q80X53 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc116Q80X53 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc116Q80X53 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc116Q80X53 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc116Q80X53 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc116Q80X53 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc116Q80X53 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc116Q80X53 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc116Q80X53 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc116Q80X53 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc116Q80X53 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc116Q80X53 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc116Q80X53 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc116Q80X53 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc116Q80X53 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc116Q80X53 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc116Q80X53 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc116Q80X53 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc116Q80X53 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc116Q80X53 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc116Q80X53 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc116Q80X53 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc116Q80X53 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc116Q80X53 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc116Q80X53 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc116Q80X53 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc116Q80X53 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc116Q80X53 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc116Q80X53 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc116Q80X53 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc116Q80X53 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc116Q80X53 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc116Q80X53 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc116Q80X53 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc116Q80X53 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc116Q80X53 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc116Q80X53 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc116Q80X53 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc116Q80X53 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc116Q80X53 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc116Q80X53 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc116Q80X53 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc116Q80X53 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc116Q80X53 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms