Protein–RNA interactions for Protein: Q80WT0

Jph4, Junctophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jph4Q80WT0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Jph4Q80WT0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
Jph4Q80WT0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Jph4Q80WT0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Jph4Q80WT0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
Jph4Q80WT0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Jph4Q80WT0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
Jph4Q80WT0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Jph4Q80WT0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
Jph4Q80WT0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
Jph4Q80WT0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
Jph4Q80WT0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Jph4Q80WT0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Jph4Q80WT0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Jph4Q80WT0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Jph4Q80WT0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Jph4Q80WT0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
Jph4Q80WT0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
Jph4Q80WT0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Jph4Q80WT0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
Jph4Q80WT0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
Jph4Q80WT0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
Jph4Q80WT0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
Jph4Q80WT0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Jph4Q80WT0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Jph4Q80WT0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Jph4Q80WT0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
Jph4Q80WT0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.04
Jph4Q80WT0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
Jph4Q80WT0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Jph4Q80WT0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Jph4Q80WT0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Jph4Q80WT0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Jph4Q80WT0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Jph4Q80WT0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
Jph4Q80WT0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Jph4Q80WT0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Jph4Q80WT0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Jph4Q80WT0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.18■■■■■ 4.02
Jph4Q80WT0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
Jph4Q80WT0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
Jph4Q80WT0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Jph4Q80WT0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Jph4Q80WT0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Jph4Q80WT0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC40.12■■■■■ 4.01
Jph4Q80WT0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Jph4Q80WT0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Jph4Q80WT0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC40.05■■■■■ 4
Jph4Q80WT0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Jph4Q80WT0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Jph4Q80WT0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC40.03■■■■■ 4
Jph4Q80WT0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC40.03■■■■■ 4
Jph4Q80WT0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Jph4Q80WT0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Jph4Q80WT0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Jph4Q80WT0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.02■■■■■ 4
Jph4Q80WT0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Jph4Q80WT0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Jph4Q80WT0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
Jph4Q80WT0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Jph4Q80WT0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Jph4Q80WT0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Jph4Q80WT0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Jph4Q80WT0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC39.96■■■■□ 3.99
Jph4Q80WT0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Jph4Q80WT0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
Jph4Q80WT0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Jph4Q80WT0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Jph4Q80WT0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Jph4Q80WT0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
Jph4Q80WT0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Jph4Q80WT0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Jph4Q80WT0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC39.87■■■■□ 3.97
Jph4Q80WT0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
Jph4Q80WT0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Jph4Q80WT0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Jph4Q80WT0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Jph4Q80WT0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
Jph4Q80WT0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
Jph4Q80WT0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Jph4Q80WT0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Jph4Q80WT0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
Jph4Q80WT0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Jph4Q80WT0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Jph4Q80WT0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Jph4Q80WT0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Jph4Q80WT0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
Jph4Q80WT0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Jph4Q80WT0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Jph4Q80WT0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Jph4Q80WT0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC39.71■■■■□ 3.95
Jph4Q80WT0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
Jph4Q80WT0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
Jph4Q80WT0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
Jph4Q80WT0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Jph4Q80WT0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Jph4Q80WT0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Jph4Q80WT0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Jph4Q80WT0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Jph4Q80WT0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms