Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc29Q80VM3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc29Q80VM3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc29Q80VM3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc29Q80VM3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc29Q80VM3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc29Q80VM3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc29Q80VM3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc29Q80VM3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc29Q80VM3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttc29Q80VM3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttc29Q80VM3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttc29Q80VM3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttc29Q80VM3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc29Q80VM3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc29Q80VM3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc29Q80VM3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc29Q80VM3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc29Q80VM3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc29Q80VM3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc29Q80VM3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc29Q80VM3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc29Q80VM3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc29Q80VM3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc29Q80VM3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttc29Q80VM3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc29Q80VM3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc29Q80VM3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc29Q80VM3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc29Q80VM3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc29Q80VM3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc29Q80VM3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ttc29Q80VM3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ttc29Q80VM3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc29Q80VM3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc29Q80VM3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc29Q80VM3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc29Q80VM3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc29Q80VM3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc29Q80VM3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc29Q80VM3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc29Q80VM3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc29Q80VM3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc29Q80VM3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc29Q80VM3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc29Q80VM3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc29Q80VM3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc29Q80VM3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc29Q80VM3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc29Q80VM3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ttc29Q80VM3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc29Q80VM3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc29Q80VM3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc29Q80VM3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc29Q80VM3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc29Q80VM3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc29Q80VM3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc29Q80VM3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc29Q80VM3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc29Q80VM3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc29Q80VM3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc29Q80VM3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc29Q80VM3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc29Q80VM3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc29Q80VM3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc29Q80VM3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc29Q80VM3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ttc29Q80VM3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc29Q80VM3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc29Q80VM3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc29Q80VM3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc29Q80VM3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc29Q80VM3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc29Q80VM3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc29Q80VM3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc29Q80VM3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc29Q80VM3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc29Q80VM3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc29Q80VM3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttc29Q80VM3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttc29Q80VM3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttc29Q80VM3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttc29Q80VM3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttc29Q80VM3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttc29Q80VM3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttc29Q80VM3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttc29Q80VM3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttc29Q80VM3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc29Q80VM3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc29Q80VM3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc29Q80VM3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc29Q80VM3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc29Q80VM3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc29Q80VM3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttc29Q80VM3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttc29Q80VM3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttc29Q80VM3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttc29Q80VM3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttc29Q80VM3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttc29Q80VM3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
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