Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd3eapQ76KJ5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd3eapQ76KJ5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd3eapQ76KJ5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd3eapQ76KJ5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd3eapQ76KJ5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd3eapQ76KJ5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd3eapQ76KJ5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cd3eapQ76KJ5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cd3eapQ76KJ5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd3eapQ76KJ5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd3eapQ76KJ5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd3eapQ76KJ5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd3eapQ76KJ5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd3eapQ76KJ5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd3eapQ76KJ5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd3eapQ76KJ5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd3eapQ76KJ5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd3eapQ76KJ5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd3eapQ76KJ5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd3eapQ76KJ5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd3eapQ76KJ5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd3eapQ76KJ5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd3eapQ76KJ5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cd3eapQ76KJ5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd3eapQ76KJ5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd3eapQ76KJ5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd3eapQ76KJ5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd3eapQ76KJ5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd3eapQ76KJ5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd3eapQ76KJ5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd3eapQ76KJ5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd3eapQ76KJ5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd3eapQ76KJ5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd3eapQ76KJ5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd3eapQ76KJ5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd3eapQ76KJ5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd3eapQ76KJ5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd3eapQ76KJ5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd3eapQ76KJ5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd3eapQ76KJ5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd3eapQ76KJ5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd3eapQ76KJ5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd3eapQ76KJ5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd3eapQ76KJ5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd3eapQ76KJ5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd3eapQ76KJ5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd3eapQ76KJ5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd3eapQ76KJ5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd3eapQ76KJ5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd3eapQ76KJ5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd3eapQ76KJ5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd3eapQ76KJ5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd3eapQ76KJ5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd3eapQ76KJ5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd3eapQ76KJ5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cd3eapQ76KJ5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cd3eapQ76KJ5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cd3eapQ76KJ5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd3eapQ76KJ5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd3eapQ76KJ5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd3eapQ76KJ5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd3eapQ76KJ5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd3eapQ76KJ5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd3eapQ76KJ5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd3eapQ76KJ5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd3eapQ76KJ5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd3eapQ76KJ5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd3eapQ76KJ5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd3eapQ76KJ5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cd3eapQ76KJ5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cd3eapQ76KJ5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd3eapQ76KJ5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd3eapQ76KJ5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd3eapQ76KJ5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd3eapQ76KJ5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd3eapQ76KJ5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd3eapQ76KJ5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd3eapQ76KJ5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cd3eapQ76KJ5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd3eapQ76KJ5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd3eapQ76KJ5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd3eapQ76KJ5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd3eapQ76KJ5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd3eapQ76KJ5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd3eapQ76KJ5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd3eapQ76KJ5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd3eapQ76KJ5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd3eapQ76KJ5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd3eapQ76KJ5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd3eapQ76KJ5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd3eapQ76KJ5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd3eapQ76KJ5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd3eapQ76KJ5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd3eapQ76KJ5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd3eapQ76KJ5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd3eapQ76KJ5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd3eapQ76KJ5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd3eapQ76KJ5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd3eapQ76KJ5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms