Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC39,7■■■■□ 3,95
Ncapd3Q6ZQK0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC39,68■■■■□ 3,94
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC39,68■■■■□ 3,94
Ncapd3Q6ZQK0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39,67■■■■□ 3,94
Ncapd3Q6ZQK0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC39,66■■■■□ 3,94
Ncapd3Q6ZQK0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC39,66■■■■□ 3,94
Ncapd3Q6ZQK0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC39,62■■■■□ 3,93
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC39,61■■■■□ 3,93
Ncapd3Q6ZQK0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,6■■■■□ 3,93
Ncapd3Q6ZQK0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC39,6■■■■□ 3,93
Ncapd3Q6ZQK0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC39,59■■■■□ 3,93
Ncapd3Q6ZQK0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,57■■■■□ 3,92
Ncapd3Q6ZQK0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC39,56■■■■□ 3,92
Ncapd3Q6ZQK0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,54■■■■□ 3,92
Ncapd3Q6ZQK0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC39,53■■■■□ 3,92
Ncapd3Q6ZQK0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,5■■■■□ 3,91
Ncapd3Q6ZQK0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC39,5■■■■□ 3,91
Ncapd3Q6ZQK0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,45■■■■□ 3,91
Ncapd3Q6ZQK0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,44■■■■□ 3,9
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC39,44■■■■□ 3,9
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,41■■■■□ 3,9
Ncapd3Q6ZQK0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,41■■■■□ 3,9
Ncapd3Q6ZQK0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,41■■■■□ 3,9
Ncapd3Q6ZQK0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC39,41■■■■□ 3,9
Ncapd3Q6ZQK0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,4■■■■□ 3,9
Ncapd3Q6ZQK0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,39■■■■□ 3,9
Ncapd3Q6ZQK0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,37■■■■□ 3,89
Ncapd3Q6ZQK0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,36■■■■□ 3,89
Ncapd3Q6ZQK0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC39,34■■■■□ 3,89
Ncapd3Q6ZQK0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,34■■■■□ 3,89
Ncapd3Q6ZQK0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39,34■■■■□ 3,89
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,32■■■■□ 3,88
Ncapd3Q6ZQK0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,3■■■■□ 3,88
Ncapd3Q6ZQK0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,29■■■■□ 3,88
Ncapd3Q6ZQK0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC39,28■■■■□ 3,88
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC39,27■■■■□ 3,88
Ncapd3Q6ZQK0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC39,26■■■■□ 3,88
Ncapd3Q6ZQK0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC39,24■■■■□ 3,87
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC39,22■■■■□ 3,87
Ncapd3Q6ZQK0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,19■■■■□ 3,86
Ncapd3Q6ZQK0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,19■■■■□ 3,86
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,19■■■■□ 3,86
Ncapd3Q6ZQK0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC39,18■■■■□ 3,86
Ncapd3Q6ZQK0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC39,17■■■■□ 3,86
Ncapd3Q6ZQK0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC39,17■■■■□ 3,86
Ncapd3Q6ZQK0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,16■■■■□ 3,86
Ncapd3Q6ZQK0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC39,11■■■■□ 3,85
Ncapd3Q6ZQK0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,05■■■■□ 3,84
Ncapd3Q6ZQK0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC39,05■■■■□ 3,84
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39,02■■■■□ 3,84
Ncapd3Q6ZQK0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3,83
Ncapd3Q6ZQK0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3,83
Ncapd3Q6ZQK0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3,83
Ncapd3Q6ZQK0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,99■■■■□ 3,83
Ncapd3Q6ZQK0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,99■■■■□ 3,83
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC38,96■■■■□ 3,83
Ncapd3Q6ZQK0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC38,95■■■■□ 3,83
Ncapd3Q6ZQK0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,94■■■■□ 3,82
Ncapd3Q6ZQK0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,9■■■■□ 3,82
Ncapd3Q6ZQK0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC38,89■■■■□ 3,82
Ncapd3Q6ZQK0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,89■■■■□ 3,82
Ncapd3Q6ZQK0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,88■■■■□ 3,81
Ncapd3Q6ZQK0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC38,88■■■■□ 3,81
Ncapd3Q6ZQK0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,87■■■■□ 3,81
Ncapd3Q6ZQK0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,86■■■■□ 3,81
Ncapd3Q6ZQK0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC38,84■■■■□ 3,81
Ncapd3Q6ZQK0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,83■■■■□ 3,81
Ncapd3Q6ZQK0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC38,83■■■■□ 3,81
Ncapd3Q6ZQK0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC38,82■■■■□ 3,81
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC38,82■■■■□ 3,8
Ncapd3Q6ZQK0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC38,81■■■■□ 3,8
Ncapd3Q6ZQK0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC38,8■■■■□ 3,8
Ncapd3Q6ZQK0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,79■■■■□ 3,8
Ncapd3Q6ZQK0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38,77■■■■□ 3,8
Ncapd3Q6ZQK0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,75■■■■□ 3,79
Ncapd3Q6ZQK0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,75■■■■□ 3,79
Ncapd3Q6ZQK0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,75■■■■□ 3,79
Ncapd3Q6ZQK0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,74■■■■□ 3,79
Ncapd3Q6ZQK0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,72■■■■□ 3,79
Ncapd3Q6ZQK0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,72■■■■□ 3,79
Ncapd3Q6ZQK0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,71■■■■□ 3,79
Ncapd3Q6ZQK0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,71■■■■□ 3,79
Ncapd3Q6ZQK0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,68■■■■□ 3,78
Ncapd3Q6ZQK0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,68■■■■□ 3,78
Ncapd3Q6ZQK0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38,65■■■■□ 3,78
Ncapd3Q6ZQK0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC38,65■■■■□ 3,78
Ncapd3Q6ZQK0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,65■■■■□ 3,78
Ncapd3Q6ZQK0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,64■■■■□ 3,78
Ncapd3Q6ZQK0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC38,64■■■■□ 3,78
Ncapd3Q6ZQK0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38,63■■■■□ 3,78
Ncapd3Q6ZQK0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC38,63■■■■□ 3,77
Ncapd3Q6ZQK0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,63■■■■□ 3,77
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,62■■■■□ 3,77
Ncapd3Q6ZQK0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,62■■■■□ 3,77
Ncapd3Q6ZQK0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC38,61■■■■□ 3,77
Ncapd3Q6ZQK0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,59■■■■□ 3,77
Ncapd3Q6ZQK0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC38,58■■■■□ 3,77
Ncapd3Q6ZQK0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,58■■■■□ 3,77
Ncapd3Q6ZQK0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC38,58■■■■□ 3,77
Ncapd3Q6ZQK0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,55■■■■□ 3,76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms