Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ssx9Q6XAS3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ssx9Q6XAS3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ssx9Q6XAS3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ssx9Q6XAS3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ssx9Q6XAS3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ssx9Q6XAS3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ssx9Q6XAS3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ssx9Q6XAS3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ssx9Q6XAS3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ssx9Q6XAS3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ssx9Q6XAS3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ssx9Q6XAS3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssx9Q6XAS3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ssx9Q6XAS3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Ssx9Q6XAS3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ssx9Q6XAS3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssx9Q6XAS3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssx9Q6XAS3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssx9Q6XAS3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssx9Q6XAS3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ssx9Q6XAS3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ssx9Q6XAS3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ssx9Q6XAS3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ssx9Q6XAS3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ssx9Q6XAS3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ssx9Q6XAS3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ssx9Q6XAS3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ssx9Q6XAS3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ssx9Q6XAS3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ssx9Q6XAS3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ssx9Q6XAS3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ssx9Q6XAS3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ssx9Q6XAS3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ssx9Q6XAS3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ssx9Q6XAS3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ssx9Q6XAS3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ssx9Q6XAS3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ssx9Q6XAS3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ssx9Q6XAS3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ssx9Q6XAS3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ssx9Q6XAS3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ssx9Q6XAS3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ssx9Q6XAS3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ssx9Q6XAS3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ssx9Q6XAS3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ssx9Q6XAS3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ssx9Q6XAS3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ssx9Q6XAS3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ssx9Q6XAS3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssx9Q6XAS3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssx9Q6XAS3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ssx9Q6XAS3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ssx9Q6XAS3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ssx9Q6XAS3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ssx9Q6XAS3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ssx9Q6XAS3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ssx9Q6XAS3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ssx9Q6XAS3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ssx9Q6XAS3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ssx9Q6XAS3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ssx9Q6XAS3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ssx9Q6XAS3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ssx9Q6XAS3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ssx9Q6XAS3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ssx9Q6XAS3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ssx9Q6XAS3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ssx9Q6XAS3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ssx9Q6XAS3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ssx9Q6XAS3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ssx9Q6XAS3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ssx9Q6XAS3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ssx9Q6XAS3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ssx9Q6XAS3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ssx9Q6XAS3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ssx9Q6XAS3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ssx9Q6XAS3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ssx9Q6XAS3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ssx9Q6XAS3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ssx9Q6XAS3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ssx9Q6XAS3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ssx9Q6XAS3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ssx9Q6XAS3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ssx9Q6XAS3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ssx9Q6XAS3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ssx9Q6XAS3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ssx9Q6XAS3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ssx9Q6XAS3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ssx9Q6XAS3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ssx9Q6XAS3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ssx9Q6XAS3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ssx9Q6XAS3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ssx9Q6XAS3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ssx9Q6XAS3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ssx9Q6XAS3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ssx9Q6XAS3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssx9Q6XAS3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssx9Q6XAS3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssx9Q6XAS3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ssx9Q6XAS3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms