Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cxcl3Q6W5C0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cxcl3Q6W5C0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cxcl3Q6W5C0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cxcl3Q6W5C0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cxcl3Q6W5C0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cxcl3Q6W5C0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cxcl3Q6W5C0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cxcl3Q6W5C0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cxcl3Q6W5C0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cxcl3Q6W5C0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cxcl3Q6W5C0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cxcl3Q6W5C0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cxcl3Q6W5C0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cxcl3Q6W5C0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cxcl3Q6W5C0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cxcl3Q6W5C0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cxcl3Q6W5C0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cxcl3Q6W5C0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cxcl3Q6W5C0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cxcl3Q6W5C0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cxcl3Q6W5C0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cxcl3Q6W5C0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cxcl3Q6W5C0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cxcl3Q6W5C0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cxcl3Q6W5C0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cxcl3Q6W5C0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cxcl3Q6W5C0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cxcl3Q6W5C0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cxcl3Q6W5C0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cxcl3Q6W5C0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cxcl3Q6W5C0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cxcl3Q6W5C0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cxcl3Q6W5C0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cxcl3Q6W5C0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cxcl3Q6W5C0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cxcl3Q6W5C0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cxcl3Q6W5C0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cxcl3Q6W5C0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cxcl3Q6W5C0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cxcl3Q6W5C0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cxcl3Q6W5C0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cxcl3Q6W5C0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cxcl3Q6W5C0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cxcl3Q6W5C0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cxcl3Q6W5C0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cxcl3Q6W5C0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cxcl3Q6W5C0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cxcl3Q6W5C0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cxcl3Q6W5C0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cxcl3Q6W5C0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cxcl3Q6W5C0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cxcl3Q6W5C0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cxcl3Q6W5C0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cxcl3Q6W5C0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cxcl3Q6W5C0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cxcl3Q6W5C0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cxcl3Q6W5C0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cxcl3Q6W5C0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cxcl3Q6W5C0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cxcl3Q6W5C0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cxcl3Q6W5C0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cxcl3Q6W5C0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cxcl3Q6W5C0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cxcl3Q6W5C0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cxcl3Q6W5C0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cxcl3Q6W5C0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cxcl3Q6W5C0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cxcl3Q6W5C0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cxcl3Q6W5C0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cxcl3Q6W5C0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cxcl3Q6W5C0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cxcl3Q6W5C0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cxcl3Q6W5C0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cxcl3Q6W5C0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cxcl3Q6W5C0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cxcl3Q6W5C0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cxcl3Q6W5C0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cxcl3Q6W5C0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cxcl3Q6W5C0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cxcl3Q6W5C0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cxcl3Q6W5C0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cxcl3Q6W5C0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cxcl3Q6W5C0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cxcl3Q6W5C0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cxcl3Q6W5C0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cxcl3Q6W5C0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cxcl3Q6W5C0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cxcl3Q6W5C0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cxcl3Q6W5C0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cxcl3Q6W5C0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cxcl3Q6W5C0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cxcl3Q6W5C0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cxcl3Q6W5C0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cxcl3Q6W5C0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cxcl3Q6W5C0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cxcl3Q6W5C0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cxcl3Q6W5C0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cxcl3Q6W5C0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cxcl3Q6W5C0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms