Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Opn5Q6VZZ7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Opn5Q6VZZ7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Opn5Q6VZZ7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Opn5Q6VZZ7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Opn5Q6VZZ7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Opn5Q6VZZ7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Opn5Q6VZZ7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Opn5Q6VZZ7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Opn5Q6VZZ7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Opn5Q6VZZ7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Opn5Q6VZZ7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Opn5Q6VZZ7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Opn5Q6VZZ7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Opn5Q6VZZ7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Opn5Q6VZZ7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Opn5Q6VZZ7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Opn5Q6VZZ7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Opn5Q6VZZ7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Opn5Q6VZZ7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Opn5Q6VZZ7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Opn5Q6VZZ7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Opn5Q6VZZ7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Opn5Q6VZZ7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Opn5Q6VZZ7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Opn5Q6VZZ7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Opn5Q6VZZ7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Opn5Q6VZZ7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Opn5Q6VZZ7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Opn5Q6VZZ7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Opn5Q6VZZ7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Opn5Q6VZZ7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Opn5Q6VZZ7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Opn5Q6VZZ7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Opn5Q6VZZ7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Opn5Q6VZZ7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Opn5Q6VZZ7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Opn5Q6VZZ7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Opn5Q6VZZ7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Opn5Q6VZZ7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Opn5Q6VZZ7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Opn5Q6VZZ7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Opn5Q6VZZ7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Opn5Q6VZZ7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Opn5Q6VZZ7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Opn5Q6VZZ7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Opn5Q6VZZ7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Opn5Q6VZZ7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Opn5Q6VZZ7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Opn5Q6VZZ7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Opn5Q6VZZ7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Opn5Q6VZZ7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Opn5Q6VZZ7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Opn5Q6VZZ7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Opn5Q6VZZ7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Opn5Q6VZZ7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Opn5Q6VZZ7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Opn5Q6VZZ7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Opn5Q6VZZ7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Opn5Q6VZZ7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Opn5Q6VZZ7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Opn5Q6VZZ7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Opn5Q6VZZ7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Opn5Q6VZZ7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Opn5Q6VZZ7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Opn5Q6VZZ7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Opn5Q6VZZ7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Opn5Q6VZZ7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Opn5Q6VZZ7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Opn5Q6VZZ7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Opn5Q6VZZ7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Opn5Q6VZZ7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Opn5Q6VZZ7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Opn5Q6VZZ7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Opn5Q6VZZ7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Opn5Q6VZZ7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Opn5Q6VZZ7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Opn5Q6VZZ7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Opn5Q6VZZ7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Opn5Q6VZZ7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Opn5Q6VZZ7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Opn5Q6VZZ7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Opn5Q6VZZ7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Opn5Q6VZZ7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Opn5Q6VZZ7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Opn5Q6VZZ7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Opn5Q6VZZ7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Opn5Q6VZZ7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Opn5Q6VZZ7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Opn5Q6VZZ7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Opn5Q6VZZ7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Opn5Q6VZZ7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Opn5Q6VZZ7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Opn5Q6VZZ7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Opn5Q6VZZ7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Opn5Q6VZZ7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Opn5Q6VZZ7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Opn5Q6VZZ7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Opn5Q6VZZ7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Opn5Q6VZZ7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.5 ms