Protein–RNA interactions for Protein: Q6VYH9

Hsh2d, Hematopoietic SH2 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsh2dQ6VYH9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hsh2dQ6VYH9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hsh2dQ6VYH9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hsh2dQ6VYH9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hsh2dQ6VYH9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hsh2dQ6VYH9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hsh2dQ6VYH9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hsh2dQ6VYH9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hsh2dQ6VYH9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Hsh2dQ6VYH9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hsh2dQ6VYH9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hsh2dQ6VYH9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hsh2dQ6VYH9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hsh2dQ6VYH9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hsh2dQ6VYH9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hsh2dQ6VYH9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hsh2dQ6VYH9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hsh2dQ6VYH9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hsh2dQ6VYH9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hsh2dQ6VYH9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hsh2dQ6VYH9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hsh2dQ6VYH9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hsh2dQ6VYH9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hsh2dQ6VYH9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hsh2dQ6VYH9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hsh2dQ6VYH9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hsh2dQ6VYH9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hsh2dQ6VYH9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hsh2dQ6VYH9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hsh2dQ6VYH9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hsh2dQ6VYH9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hsh2dQ6VYH9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hsh2dQ6VYH9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hsh2dQ6VYH9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hsh2dQ6VYH9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hsh2dQ6VYH9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hsh2dQ6VYH9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hsh2dQ6VYH9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hsh2dQ6VYH9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hsh2dQ6VYH9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hsh2dQ6VYH9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hsh2dQ6VYH9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hsh2dQ6VYH9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hsh2dQ6VYH9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hsh2dQ6VYH9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hsh2dQ6VYH9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hsh2dQ6VYH9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hsh2dQ6VYH9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hsh2dQ6VYH9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hsh2dQ6VYH9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hsh2dQ6VYH9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hsh2dQ6VYH9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hsh2dQ6VYH9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hsh2dQ6VYH9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hsh2dQ6VYH9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hsh2dQ6VYH9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hsh2dQ6VYH9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hsh2dQ6VYH9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hsh2dQ6VYH9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hsh2dQ6VYH9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hsh2dQ6VYH9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hsh2dQ6VYH9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hsh2dQ6VYH9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hsh2dQ6VYH9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hsh2dQ6VYH9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hsh2dQ6VYH9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hsh2dQ6VYH9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hsh2dQ6VYH9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hsh2dQ6VYH9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hsh2dQ6VYH9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hsh2dQ6VYH9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Hsh2dQ6VYH9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hsh2dQ6VYH9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hsh2dQ6VYH9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hsh2dQ6VYH9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hsh2dQ6VYH9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hsh2dQ6VYH9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hsh2dQ6VYH9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hsh2dQ6VYH9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hsh2dQ6VYH9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hsh2dQ6VYH9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hsh2dQ6VYH9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hsh2dQ6VYH9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hsh2dQ6VYH9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hsh2dQ6VYH9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hsh2dQ6VYH9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hsh2dQ6VYH9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hsh2dQ6VYH9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hsh2dQ6VYH9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hsh2dQ6VYH9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hsh2dQ6VYH9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hsh2dQ6VYH9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hsh2dQ6VYH9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hsh2dQ6VYH9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hsh2dQ6VYH9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hsh2dQ6VYH9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hsh2dQ6VYH9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hsh2dQ6VYH9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hsh2dQ6VYH9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hsh2dQ6VYH9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms