Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN9

Rab35, Ras-related protein Rab-35, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab35Q6PHN9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab35Q6PHN9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab35Q6PHN9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab35Q6PHN9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab35Q6PHN9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab35Q6PHN9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab35Q6PHN9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab35Q6PHN9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab35Q6PHN9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab35Q6PHN9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab35Q6PHN9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab35Q6PHN9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab35Q6PHN9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab35Q6PHN9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab35Q6PHN9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab35Q6PHN9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab35Q6PHN9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab35Q6PHN9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab35Q6PHN9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rab35Q6PHN9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab35Q6PHN9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab35Q6PHN9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab35Q6PHN9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab35Q6PHN9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab35Q6PHN9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab35Q6PHN9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab35Q6PHN9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab35Q6PHN9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab35Q6PHN9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab35Q6PHN9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab35Q6PHN9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab35Q6PHN9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab35Q6PHN9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab35Q6PHN9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab35Q6PHN9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab35Q6PHN9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab35Q6PHN9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab35Q6PHN9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab35Q6PHN9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab35Q6PHN9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab35Q6PHN9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab35Q6PHN9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab35Q6PHN9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab35Q6PHN9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab35Q6PHN9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab35Q6PHN9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab35Q6PHN9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab35Q6PHN9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab35Q6PHN9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab35Q6PHN9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab35Q6PHN9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab35Q6PHN9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab35Q6PHN9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab35Q6PHN9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab35Q6PHN9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab35Q6PHN9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab35Q6PHN9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab35Q6PHN9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab35Q6PHN9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab35Q6PHN9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab35Q6PHN9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab35Q6PHN9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab35Q6PHN9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab35Q6PHN9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab35Q6PHN9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab35Q6PHN9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab35Q6PHN9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab35Q6PHN9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab35Q6PHN9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab35Q6PHN9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab35Q6PHN9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab35Q6PHN9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab35Q6PHN9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab35Q6PHN9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab35Q6PHN9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab35Q6PHN9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab35Q6PHN9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab35Q6PHN9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab35Q6PHN9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab35Q6PHN9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab35Q6PHN9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab35Q6PHN9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab35Q6PHN9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab35Q6PHN9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab35Q6PHN9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab35Q6PHN9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab35Q6PHN9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab35Q6PHN9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab35Q6PHN9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab35Q6PHN9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab35Q6PHN9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rab35Q6PHN9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rab35Q6PHN9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab35Q6PHN9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab35Q6PHN9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab35Q6PHN9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab35Q6PHN9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab35Q6PHN9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab35Q6PHN9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab35Q6PHN9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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