Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE3

Rrm2b, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrm2bQ6PEE3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrm2bQ6PEE3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrm2bQ6PEE3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrm2bQ6PEE3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrm2bQ6PEE3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrm2bQ6PEE3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrm2bQ6PEE3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrm2bQ6PEE3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrm2bQ6PEE3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrm2bQ6PEE3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrm2bQ6PEE3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrm2bQ6PEE3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrm2bQ6PEE3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrm2bQ6PEE3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rrm2bQ6PEE3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rrm2bQ6PEE3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rrm2bQ6PEE3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rrm2bQ6PEE3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rrm2bQ6PEE3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrm2bQ6PEE3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrm2bQ6PEE3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrm2bQ6PEE3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrm2bQ6PEE3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrm2bQ6PEE3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrm2bQ6PEE3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrm2bQ6PEE3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrm2bQ6PEE3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrm2bQ6PEE3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rrm2bQ6PEE3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrm2bQ6PEE3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrm2bQ6PEE3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrm2bQ6PEE3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrm2bQ6PEE3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrm2bQ6PEE3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrm2bQ6PEE3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrm2bQ6PEE3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrm2bQ6PEE3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rrm2bQ6PEE3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rrm2bQ6PEE3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rrm2bQ6PEE3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrm2bQ6PEE3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrm2bQ6PEE3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrm2bQ6PEE3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrm2bQ6PEE3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrm2bQ6PEE3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrm2bQ6PEE3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrm2bQ6PEE3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrm2bQ6PEE3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrm2bQ6PEE3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rrm2bQ6PEE3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rrm2bQ6PEE3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rrm2bQ6PEE3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rrm2bQ6PEE3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rrm2bQ6PEE3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rrm2bQ6PEE3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrm2bQ6PEE3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrm2bQ6PEE3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrm2bQ6PEE3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrm2bQ6PEE3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrm2bQ6PEE3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrm2bQ6PEE3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrm2bQ6PEE3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrm2bQ6PEE3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrm2bQ6PEE3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrm2bQ6PEE3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrm2bQ6PEE3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rrm2bQ6PEE3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrm2bQ6PEE3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrm2bQ6PEE3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrm2bQ6PEE3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrm2bQ6PEE3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrm2bQ6PEE3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrm2bQ6PEE3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrm2bQ6PEE3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrm2bQ6PEE3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrm2bQ6PEE3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrm2bQ6PEE3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrm2bQ6PEE3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrm2bQ6PEE3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrm2bQ6PEE3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrm2bQ6PEE3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrm2bQ6PEE3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrm2bQ6PEE3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Rrm2bQ6PEE3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrm2bQ6PEE3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrm2bQ6PEE3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrm2bQ6PEE3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrm2bQ6PEE3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrm2bQ6PEE3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrm2bQ6PEE3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrm2bQ6PEE3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrm2bQ6PEE3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrm2bQ6PEE3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrm2bQ6PEE3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrm2bQ6PEE3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrm2bQ6PEE3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrm2bQ6PEE3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrm2bQ6PEE3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrm2bQ6PEE3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrm2bQ6PEE3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms