Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bhlhb9Q6PB60 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bhlhb9Q6PB60 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bhlhb9Q6PB60 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bhlhb9Q6PB60 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bhlhb9Q6PB60 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bhlhb9Q6PB60 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bhlhb9Q6PB60 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bhlhb9Q6PB60 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bhlhb9Q6PB60 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bhlhb9Q6PB60 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bhlhb9Q6PB60 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Bhlhb9Q6PB60 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bhlhb9Q6PB60 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bhlhb9Q6PB60 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bhlhb9Q6PB60 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bhlhb9Q6PB60 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bhlhb9Q6PB60 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bhlhb9Q6PB60 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bhlhb9Q6PB60 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bhlhb9Q6PB60 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bhlhb9Q6PB60 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Bhlhb9Q6PB60 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Bhlhb9Q6PB60 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bhlhb9Q6PB60 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bhlhb9Q6PB60 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bhlhb9Q6PB60 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bhlhb9Q6PB60 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bhlhb9Q6PB60 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bhlhb9Q6PB60 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bhlhb9Q6PB60 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bhlhb9Q6PB60 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bhlhb9Q6PB60 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bhlhb9Q6PB60 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bhlhb9Q6PB60 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bhlhb9Q6PB60 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bhlhb9Q6PB60 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bhlhb9Q6PB60 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bhlhb9Q6PB60 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Bhlhb9Q6PB60 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bhlhb9Q6PB60 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bhlhb9Q6PB60 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bhlhb9Q6PB60 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bhlhb9Q6PB60 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bhlhb9Q6PB60 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bhlhb9Q6PB60 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bhlhb9Q6PB60 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Bhlhb9Q6PB60 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Bhlhb9Q6PB60 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bhlhb9Q6PB60 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bhlhb9Q6PB60 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bhlhb9Q6PB60 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bhlhb9Q6PB60 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bhlhb9Q6PB60 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bhlhb9Q6PB60 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bhlhb9Q6PB60 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bhlhb9Q6PB60 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bhlhb9Q6PB60 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bhlhb9Q6PB60 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bhlhb9Q6PB60 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bhlhb9Q6PB60 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bhlhb9Q6PB60 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bhlhb9Q6PB60 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bhlhb9Q6PB60 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Bhlhb9Q6PB60 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bhlhb9Q6PB60 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bhlhb9Q6PB60 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bhlhb9Q6PB60 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bhlhb9Q6PB60 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bhlhb9Q6PB60 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bhlhb9Q6PB60 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bhlhb9Q6PB60 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bhlhb9Q6PB60 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bhlhb9Q6PB60 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bhlhb9Q6PB60 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bhlhb9Q6PB60 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bhlhb9Q6PB60 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bhlhb9Q6PB60 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bhlhb9Q6PB60 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bhlhb9Q6PB60 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Bhlhb9Q6PB60 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bhlhb9Q6PB60 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bhlhb9Q6PB60 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bhlhb9Q6PB60 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bhlhb9Q6PB60 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bhlhb9Q6PB60 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bhlhb9Q6PB60 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Bhlhb9Q6PB60 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bhlhb9Q6PB60 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Bhlhb9Q6PB60 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bhlhb9Q6PB60 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bhlhb9Q6PB60 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bhlhb9Q6PB60 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bhlhb9Q6PB60 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bhlhb9Q6PB60 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bhlhb9Q6PB60 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bhlhb9Q6PB60 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bhlhb9Q6PB60 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bhlhb9Q6PB60 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bhlhb9Q6PB60 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms