Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rrp12Q6P5B0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rrp12Q6P5B0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rrp12Q6P5B0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rrp12Q6P5B0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Rrp12Q6P5B0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rrp12Q6P5B0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rrp12Q6P5B0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rrp12Q6P5B0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Rrp12Q6P5B0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rrp12Q6P5B0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rrp12Q6P5B0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rrp12Q6P5B0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rrp12Q6P5B0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rrp12Q6P5B0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rrp12Q6P5B0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rrp12Q6P5B0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rrp12Q6P5B0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rrp12Q6P5B0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rrp12Q6P5B0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rrp12Q6P5B0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rrp12Q6P5B0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rrp12Q6P5B0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Rrp12Q6P5B0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rrp12Q6P5B0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Rrp12Q6P5B0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rrp12Q6P5B0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rrp12Q6P5B0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rrp12Q6P5B0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rrp12Q6P5B0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Rrp12Q6P5B0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rrp12Q6P5B0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rrp12Q6P5B0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rrp12Q6P5B0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rrp12Q6P5B0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rrp12Q6P5B0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rrp12Q6P5B0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rrp12Q6P5B0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rrp12Q6P5B0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rrp12Q6P5B0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rrp12Q6P5B0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rrp12Q6P5B0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rrp12Q6P5B0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rrp12Q6P5B0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Rrp12Q6P5B0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rrp12Q6P5B0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rrp12Q6P5B0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rrp12Q6P5B0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rrp12Q6P5B0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rrp12Q6P5B0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rrp12Q6P5B0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rrp12Q6P5B0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rrp12Q6P5B0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rrp12Q6P5B0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rrp12Q6P5B0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rrp12Q6P5B0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rrp12Q6P5B0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rrp12Q6P5B0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rrp12Q6P5B0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rrp12Q6P5B0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rrp12Q6P5B0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rrp12Q6P5B0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rrp12Q6P5B0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rrp12Q6P5B0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rrp12Q6P5B0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rrp12Q6P5B0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rrp12Q6P5B0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Rrp12Q6P5B0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rrp12Q6P5B0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rrp12Q6P5B0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rrp12Q6P5B0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rrp12Q6P5B0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rrp12Q6P5B0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rrp12Q6P5B0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rrp12Q6P5B0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rrp12Q6P5B0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rrp12Q6P5B0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rrp12Q6P5B0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rrp12Q6P5B0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rrp12Q6P5B0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rrp12Q6P5B0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rrp12Q6P5B0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rrp12Q6P5B0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rrp12Q6P5B0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rrp12Q6P5B0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rrp12Q6P5B0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rrp12Q6P5B0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rrp12Q6P5B0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rrp12Q6P5B0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rrp12Q6P5B0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rrp12Q6P5B0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rrp12Q6P5B0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rrp12Q6P5B0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rrp12Q6P5B0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rrp12Q6P5B0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Rrp12Q6P5B0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rrp12Q6P5B0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rrp12Q6P5B0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rrp12Q6P5B0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rrp12Q6P5B0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms