Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E1

Zmiz1, Zinc finger MIZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmiz1Q6P1E1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zmiz1Q6P1E1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zmiz1Q6P1E1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zmiz1Q6P1E1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zmiz1Q6P1E1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zmiz1Q6P1E1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Zmiz1Q6P1E1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zmiz1Q6P1E1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zmiz1Q6P1E1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zmiz1Q6P1E1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zmiz1Q6P1E1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zmiz1Q6P1E1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zmiz1Q6P1E1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zmiz1Q6P1E1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zmiz1Q6P1E1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zmiz1Q6P1E1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zmiz1Q6P1E1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zmiz1Q6P1E1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zmiz1Q6P1E1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zmiz1Q6P1E1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zmiz1Q6P1E1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zmiz1Q6P1E1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zmiz1Q6P1E1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zmiz1Q6P1E1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zmiz1Q6P1E1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zmiz1Q6P1E1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zmiz1Q6P1E1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zmiz1Q6P1E1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zmiz1Q6P1E1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zmiz1Q6P1E1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zmiz1Q6P1E1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zmiz1Q6P1E1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zmiz1Q6P1E1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zmiz1Q6P1E1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zmiz1Q6P1E1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zmiz1Q6P1E1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zmiz1Q6P1E1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zmiz1Q6P1E1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zmiz1Q6P1E1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zmiz1Q6P1E1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zmiz1Q6P1E1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zmiz1Q6P1E1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zmiz1Q6P1E1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zmiz1Q6P1E1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zmiz1Q6P1E1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zmiz1Q6P1E1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zmiz1Q6P1E1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zmiz1Q6P1E1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zmiz1Q6P1E1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Zmiz1Q6P1E1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zmiz1Q6P1E1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zmiz1Q6P1E1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zmiz1Q6P1E1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zmiz1Q6P1E1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zmiz1Q6P1E1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zmiz1Q6P1E1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zmiz1Q6P1E1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zmiz1Q6P1E1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zmiz1Q6P1E1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zmiz1Q6P1E1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zmiz1Q6P1E1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zmiz1Q6P1E1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zmiz1Q6P1E1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zmiz1Q6P1E1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zmiz1Q6P1E1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zmiz1Q6P1E1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zmiz1Q6P1E1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Zmiz1Q6P1E1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Zmiz1Q6P1E1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zmiz1Q6P1E1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zmiz1Q6P1E1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zmiz1Q6P1E1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Zmiz1Q6P1E1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zmiz1Q6P1E1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zmiz1Q6P1E1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zmiz1Q6P1E1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zmiz1Q6P1E1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zmiz1Q6P1E1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zmiz1Q6P1E1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zmiz1Q6P1E1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zmiz1Q6P1E1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Zmiz1Q6P1E1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Zmiz1Q6P1E1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zmiz1Q6P1E1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zmiz1Q6P1E1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zmiz1Q6P1E1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zmiz1Q6P1E1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zmiz1Q6P1E1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zmiz1Q6P1E1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zmiz1Q6P1E1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zmiz1Q6P1E1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zmiz1Q6P1E1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zmiz1Q6P1E1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zmiz1Q6P1E1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zmiz1Q6P1E1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zmiz1Q6P1E1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zmiz1Q6P1E1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Zmiz1Q6P1E1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zmiz1Q6P1E1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zmiz1Q6P1E1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms