Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS82

Retreg2, Reticulophagy regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg2Q6NS82 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retreg2Q6NS82 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retreg2Q6NS82 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retreg2Q6NS82 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retreg2Q6NS82 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retreg2Q6NS82 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retreg2Q6NS82 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retreg2Q6NS82 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retreg2Q6NS82 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retreg2Q6NS82 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retreg2Q6NS82 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retreg2Q6NS82 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Retreg2Q6NS82 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retreg2Q6NS82 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retreg2Q6NS82 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retreg2Q6NS82 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retreg2Q6NS82 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Retreg2Q6NS82 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retreg2Q6NS82 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retreg2Q6NS82 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retreg2Q6NS82 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retreg2Q6NS82 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retreg2Q6NS82 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retreg2Q6NS82 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retreg2Q6NS82 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retreg2Q6NS82 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retreg2Q6NS82 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retreg2Q6NS82 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retreg2Q6NS82 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retreg2Q6NS82 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retreg2Q6NS82 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retreg2Q6NS82 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Retreg2Q6NS82 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retreg2Q6NS82 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Retreg2Q6NS82 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retreg2Q6NS82 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retreg2Q6NS82 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retreg2Q6NS82 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retreg2Q6NS82 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retreg2Q6NS82 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retreg2Q6NS82 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retreg2Q6NS82 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retreg2Q6NS82 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retreg2Q6NS82 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retreg2Q6NS82 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retreg2Q6NS82 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retreg2Q6NS82 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retreg2Q6NS82 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retreg2Q6NS82 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retreg2Q6NS82 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retreg2Q6NS82 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retreg2Q6NS82 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retreg2Q6NS82 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retreg2Q6NS82 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retreg2Q6NS82 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retreg2Q6NS82 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Retreg2Q6NS82 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retreg2Q6NS82 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retreg2Q6NS82 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retreg2Q6NS82 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retreg2Q6NS82 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retreg2Q6NS82 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retreg2Q6NS82 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retreg2Q6NS82 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retreg2Q6NS82 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retreg2Q6NS82 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retreg2Q6NS82 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retreg2Q6NS82 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retreg2Q6NS82 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retreg2Q6NS82 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retreg2Q6NS82 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Retreg2Q6NS82 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retreg2Q6NS82 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retreg2Q6NS82 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retreg2Q6NS82 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Retreg2Q6NS82 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retreg2Q6NS82 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retreg2Q6NS82 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retreg2Q6NS82 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retreg2Q6NS82 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retreg2Q6NS82 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retreg2Q6NS82 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retreg2Q6NS82 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retreg2Q6NS82 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retreg2Q6NS82 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retreg2Q6NS82 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retreg2Q6NS82 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retreg2Q6NS82 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retreg2Q6NS82 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retreg2Q6NS82 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retreg2Q6NS82 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retreg2Q6NS82 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retreg2Q6NS82 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retreg2Q6NS82 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retreg2Q6NS82 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retreg2Q6NS82 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retreg2Q6NS82 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retreg2Q6NS82 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retreg2Q6NS82 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retreg2Q6NS82 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms