Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KdsrQ6GV12 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KdsrQ6GV12 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KdsrQ6GV12 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KdsrQ6GV12 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KdsrQ6GV12 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KdsrQ6GV12 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KdsrQ6GV12 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KdsrQ6GV12 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KdsrQ6GV12 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KdsrQ6GV12 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KdsrQ6GV12 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KdsrQ6GV12 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KdsrQ6GV12 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KdsrQ6GV12 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KdsrQ6GV12 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KdsrQ6GV12 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KdsrQ6GV12 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KdsrQ6GV12 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KdsrQ6GV12 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KdsrQ6GV12 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KdsrQ6GV12 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KdsrQ6GV12 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KdsrQ6GV12 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KdsrQ6GV12 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KdsrQ6GV12 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KdsrQ6GV12 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KdsrQ6GV12 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KdsrQ6GV12 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KdsrQ6GV12 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KdsrQ6GV12 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KdsrQ6GV12 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KdsrQ6GV12 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KdsrQ6GV12 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KdsrQ6GV12 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KdsrQ6GV12 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KdsrQ6GV12 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KdsrQ6GV12 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KdsrQ6GV12 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KdsrQ6GV12 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KdsrQ6GV12 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KdsrQ6GV12 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KdsrQ6GV12 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KdsrQ6GV12 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KdsrQ6GV12 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KdsrQ6GV12 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KdsrQ6GV12 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KdsrQ6GV12 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KdsrQ6GV12 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KdsrQ6GV12 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KdsrQ6GV12 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KdsrQ6GV12 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KdsrQ6GV12 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KdsrQ6GV12 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KdsrQ6GV12 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KdsrQ6GV12 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KdsrQ6GV12 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KdsrQ6GV12 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KdsrQ6GV12 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KdsrQ6GV12 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KdsrQ6GV12 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KdsrQ6GV12 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KdsrQ6GV12 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KdsrQ6GV12 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KdsrQ6GV12 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KdsrQ6GV12 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KdsrQ6GV12 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KdsrQ6GV12 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KdsrQ6GV12 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KdsrQ6GV12 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KdsrQ6GV12 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KdsrQ6GV12 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KdsrQ6GV12 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KdsrQ6GV12 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KdsrQ6GV12 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KdsrQ6GV12 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KdsrQ6GV12 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KdsrQ6GV12 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KdsrQ6GV12 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KdsrQ6GV12 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KdsrQ6GV12 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KdsrQ6GV12 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KdsrQ6GV12 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KdsrQ6GV12 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KdsrQ6GV12 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KdsrQ6GV12 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KdsrQ6GV12 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KdsrQ6GV12 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KdsrQ6GV12 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KdsrQ6GV12 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KdsrQ6GV12 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KdsrQ6GV12 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KdsrQ6GV12 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KdsrQ6GV12 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KdsrQ6GV12 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KdsrQ6GV12 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KdsrQ6GV12 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KdsrQ6GV12 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KdsrQ6GV12 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KdsrQ6GV12 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms