Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KdsrQ6GV12 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KdsrQ6GV12 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KdsrQ6GV12 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KdsrQ6GV12 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KdsrQ6GV12 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KdsrQ6GV12 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KdsrQ6GV12 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KdsrQ6GV12 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KdsrQ6GV12 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KdsrQ6GV12 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KdsrQ6GV12 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KdsrQ6GV12 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KdsrQ6GV12 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KdsrQ6GV12 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KdsrQ6GV12 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KdsrQ6GV12 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KdsrQ6GV12 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KdsrQ6GV12 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KdsrQ6GV12 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KdsrQ6GV12 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KdsrQ6GV12 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KdsrQ6GV12 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KdsrQ6GV12 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KdsrQ6GV12 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KdsrQ6GV12 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KdsrQ6GV12 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KdsrQ6GV12 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KdsrQ6GV12 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KdsrQ6GV12 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KdsrQ6GV12 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KdsrQ6GV12 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KdsrQ6GV12 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KdsrQ6GV12 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KdsrQ6GV12 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KdsrQ6GV12 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KdsrQ6GV12 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KdsrQ6GV12 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KdsrQ6GV12 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KdsrQ6GV12 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KdsrQ6GV12 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KdsrQ6GV12 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KdsrQ6GV12 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KdsrQ6GV12 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KdsrQ6GV12 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KdsrQ6GV12 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KdsrQ6GV12 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KdsrQ6GV12 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KdsrQ6GV12 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KdsrQ6GV12 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KdsrQ6GV12 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KdsrQ6GV12 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KdsrQ6GV12 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KdsrQ6GV12 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KdsrQ6GV12 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KdsrQ6GV12 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KdsrQ6GV12 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KdsrQ6GV12 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KdsrQ6GV12 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KdsrQ6GV12 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KdsrQ6GV12 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KdsrQ6GV12 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KdsrQ6GV12 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KdsrQ6GV12 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KdsrQ6GV12 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KdsrQ6GV12 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KdsrQ6GV12 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KdsrQ6GV12 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KdsrQ6GV12 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KdsrQ6GV12 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KdsrQ6GV12 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KdsrQ6GV12 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KdsrQ6GV12 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KdsrQ6GV12 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KdsrQ6GV12 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KdsrQ6GV12 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KdsrQ6GV12 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KdsrQ6GV12 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KdsrQ6GV12 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KdsrQ6GV12 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KdsrQ6GV12 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KdsrQ6GV12 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KdsrQ6GV12 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KdsrQ6GV12 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KdsrQ6GV12 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KdsrQ6GV12 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KdsrQ6GV12 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KdsrQ6GV12 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KdsrQ6GV12 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KdsrQ6GV12 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KdsrQ6GV12 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KdsrQ6GV12 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KdsrQ6GV12 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KdsrQ6GV12 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KdsrQ6GV12 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KdsrQ6GV12 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KdsrQ6GV12 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KdsrQ6GV12 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KdsrQ6GV12 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KdsrQ6GV12 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms