Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Scaf8Q6DID3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Scaf8Q6DID3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Scaf8Q6DID3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Scaf8Q6DID3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Scaf8Q6DID3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Scaf8Q6DID3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Scaf8Q6DID3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Scaf8Q6DID3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Scaf8Q6DID3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Scaf8Q6DID3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Scaf8Q6DID3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Scaf8Q6DID3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Scaf8Q6DID3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Scaf8Q6DID3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Scaf8Q6DID3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Scaf8Q6DID3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Scaf8Q6DID3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Scaf8Q6DID3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Scaf8Q6DID3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Scaf8Q6DID3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Scaf8Q6DID3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Scaf8Q6DID3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Scaf8Q6DID3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Scaf8Q6DID3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Scaf8Q6DID3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Scaf8Q6DID3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Scaf8Q6DID3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Scaf8Q6DID3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Scaf8Q6DID3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Scaf8Q6DID3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Scaf8Q6DID3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Scaf8Q6DID3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Scaf8Q6DID3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Scaf8Q6DID3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Scaf8Q6DID3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Scaf8Q6DID3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Scaf8Q6DID3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Scaf8Q6DID3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Scaf8Q6DID3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Scaf8Q6DID3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Scaf8Q6DID3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Scaf8Q6DID3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Scaf8Q6DID3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Scaf8Q6DID3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Scaf8Q6DID3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Scaf8Q6DID3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Scaf8Q6DID3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Scaf8Q6DID3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Scaf8Q6DID3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Scaf8Q6DID3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Scaf8Q6DID3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Scaf8Q6DID3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Scaf8Q6DID3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Scaf8Q6DID3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Scaf8Q6DID3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Scaf8Q6DID3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Scaf8Q6DID3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Scaf8Q6DID3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Scaf8Q6DID3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Scaf8Q6DID3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Scaf8Q6DID3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Scaf8Q6DID3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Scaf8Q6DID3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Scaf8Q6DID3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Scaf8Q6DID3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Scaf8Q6DID3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Scaf8Q6DID3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Scaf8Q6DID3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Scaf8Q6DID3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Scaf8Q6DID3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Scaf8Q6DID3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Scaf8Q6DID3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Scaf8Q6DID3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Scaf8Q6DID3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Scaf8Q6DID3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Scaf8Q6DID3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Scaf8Q6DID3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Scaf8Q6DID3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Scaf8Q6DID3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Scaf8Q6DID3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Scaf8Q6DID3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Scaf8Q6DID3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Scaf8Q6DID3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Scaf8Q6DID3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Scaf8Q6DID3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Scaf8Q6DID3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Scaf8Q6DID3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Scaf8Q6DID3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Scaf8Q6DID3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Scaf8Q6DID3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Scaf8Q6DID3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Scaf8Q6DID3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Scaf8Q6DID3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Scaf8Q6DID3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Scaf8Q6DID3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Scaf8Q6DID3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Scaf8Q6DID3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Scaf8Q6DID3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Scaf8Q6DID3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms