Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp7Q6A4J8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp7Q6A4J8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp7Q6A4J8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp7Q6A4J8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp7Q6A4J8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp7Q6A4J8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp7Q6A4J8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp7Q6A4J8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp7Q6A4J8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp7Q6A4J8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp7Q6A4J8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp7Q6A4J8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp7Q6A4J8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp7Q6A4J8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp7Q6A4J8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp7Q6A4J8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp7Q6A4J8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp7Q6A4J8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp7Q6A4J8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp7Q6A4J8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp7Q6A4J8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp7Q6A4J8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp7Q6A4J8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp7Q6A4J8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp7Q6A4J8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp7Q6A4J8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp7Q6A4J8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp7Q6A4J8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp7Q6A4J8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp7Q6A4J8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp7Q6A4J8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp7Q6A4J8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp7Q6A4J8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp7Q6A4J8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp7Q6A4J8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp7Q6A4J8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp7Q6A4J8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp7Q6A4J8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp7Q6A4J8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp7Q6A4J8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp7Q6A4J8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp7Q6A4J8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp7Q6A4J8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp7Q6A4J8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp7Q6A4J8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp7Q6A4J8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp7Q6A4J8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp7Q6A4J8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp7Q6A4J8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp7Q6A4J8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp7Q6A4J8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp7Q6A4J8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp7Q6A4J8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp7Q6A4J8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Usp7Q6A4J8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp7Q6A4J8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp7Q6A4J8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp7Q6A4J8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp7Q6A4J8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp7Q6A4J8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp7Q6A4J8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp7Q6A4J8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp7Q6A4J8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp7Q6A4J8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp7Q6A4J8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp7Q6A4J8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp7Q6A4J8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp7Q6A4J8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp7Q6A4J8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp7Q6A4J8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp7Q6A4J8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp7Q6A4J8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp7Q6A4J8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp7Q6A4J8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp7Q6A4J8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp7Q6A4J8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp7Q6A4J8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp7Q6A4J8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp7Q6A4J8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp7Q6A4J8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp7Q6A4J8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp7Q6A4J8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp7Q6A4J8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp7Q6A4J8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp7Q6A4J8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp7Q6A4J8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp7Q6A4J8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp7Q6A4J8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp7Q6A4J8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp7Q6A4J8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp7Q6A4J8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp7Q6A4J8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp7Q6A4J8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp7Q6A4J8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp7Q6A4J8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp7Q6A4J8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp7Q6A4J8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp7Q6A4J8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp7Q6A4J8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms