Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tmcc1Q69ZZ6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmcc1Q69ZZ6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmcc1Q69ZZ6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmcc1Q69ZZ6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmcc1Q69ZZ6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmcc1Q69ZZ6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmcc1Q69ZZ6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmcc1Q69ZZ6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmcc1Q69ZZ6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmcc1Q69ZZ6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmcc1Q69ZZ6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmcc1Q69ZZ6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmcc1Q69ZZ6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmcc1Q69ZZ6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tmcc1Q69ZZ6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmcc1Q69ZZ6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmcc1Q69ZZ6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmcc1Q69ZZ6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmcc1Q69ZZ6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmcc1Q69ZZ6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmcc1Q69ZZ6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmcc1Q69ZZ6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmcc1Q69ZZ6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmcc1Q69ZZ6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmcc1Q69ZZ6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmcc1Q69ZZ6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmcc1Q69ZZ6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmcc1Q69ZZ6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmcc1Q69ZZ6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmcc1Q69ZZ6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmcc1Q69ZZ6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmcc1Q69ZZ6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmcc1Q69ZZ6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmcc1Q69ZZ6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmcc1Q69ZZ6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmcc1Q69ZZ6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmcc1Q69ZZ6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmcc1Q69ZZ6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmcc1Q69ZZ6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmcc1Q69ZZ6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmcc1Q69ZZ6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmcc1Q69ZZ6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmcc1Q69ZZ6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmcc1Q69ZZ6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmcc1Q69ZZ6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmcc1Q69ZZ6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmcc1Q69ZZ6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmcc1Q69ZZ6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmcc1Q69ZZ6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmcc1Q69ZZ6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmcc1Q69ZZ6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmcc1Q69ZZ6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmcc1Q69ZZ6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmcc1Q69ZZ6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmcc1Q69ZZ6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmcc1Q69ZZ6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmcc1Q69ZZ6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmcc1Q69ZZ6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmcc1Q69ZZ6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmcc1Q69ZZ6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmcc1Q69ZZ6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmcc1Q69ZZ6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmcc1Q69ZZ6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmcc1Q69ZZ6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmcc1Q69ZZ6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmcc1Q69ZZ6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmcc1Q69ZZ6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmcc1Q69ZZ6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmcc1Q69ZZ6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmcc1Q69ZZ6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmcc1Q69ZZ6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmcc1Q69ZZ6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmcc1Q69ZZ6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1069.3 ms